More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3828 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 772 aa  1556    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  47.75 
 
 		 747 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  46.69 
 
 		 735 aa  572  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  45.2 
 
 		 768 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  46.12 
 
 		 747 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  44.78 
 
 		 746 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  46.27 
 
 		 749 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  46.74 
 
 		 745 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  44.94 
 
 		 760 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  44.1 
 
 		 757 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  44.84 
 
 		 788 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  41.79 
 
 		 723 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 		 774 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  43.6 
 
 		 776 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  42.42 
 
 		 774 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  43.45 
 
 		 747 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  40.95 
 
 		 709 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  39.41 
 
 		 685 aa  406  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.6 
 
 		 652 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 		 685 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 712 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  39.4 
 
 		 691 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  39.23 
 
 		 691 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  35.55 
 
 		 804 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  41.58 
 
 		 680 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  33.82 
 
 		 654 aa  356  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  35.3 
 
 		 664 aa  312  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  33.23 
 
 		 686 aa  312  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  32.92 
 
 		 726 aa  280  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  34.18 
 
 		 680 aa  273  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  33.17 
 
 		 649 aa  273  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  35.97 
 
 		 677 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  35.97 
 
 		 653 aa  271  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 		 649 aa  257  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  32.19 
 
 		 679 aa  250  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  30.11 
 
 		 655 aa  231  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 672 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  32.95 
 
 		 716 aa  210  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  29.95 
 
 		 682 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  30.63 
 
 		 673 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 677 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  34.23 
 
 		 654 aa  125  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  29.89 
 
 		 590 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  29.84 
 
 		 750 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  30.02 
 
 		 750 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  28.36 
 
 		 715 aa  118  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  30.02 
 
 		 750 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  41.73 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  30.98 
 
 		 592 aa  115  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.63 
 
 		 663 aa  110  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.65 
 
 		 669 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  43.26 
 
 		 643 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  41.13 
 
 		 660 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  31.99 
 
 		 686 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  39.86 
 
 		 642 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.27 
 
 		 716 aa  107  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  39.86 
 
 		 642 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  29.29 
 
 		 748 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  39.71 
 
 		 593 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  41.84 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  31.46 
 
 		 649 aa  105  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  31.13 
 
 		 649 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 642 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 		 690 aa  104  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  29.45 
 
 		 808 aa  104  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  38.97 
 
 		 593 aa  104  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  26.93 
 
 		 756 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  29.83 
 
 		 628 aa  103  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  29.79 
 
 		 616 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.52 
 
 		 201 aa  103  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  31.01 
 
 		 677 aa  102  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 642 aa  102  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  41.13 
 
 		 642 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.36 
 
 		 638 aa  101  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  39.01 
 
 		 657 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  31.67 
 
 		 661 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  38.36 
 
 		 645 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  27.83 
 
 		 709 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  39.72 
 
 		 642 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  39.01 
 
 		 641 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  39.01 
 
 		 649 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  29.28 
 
 		 730 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  29.28 
 
 		 730 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  29.15 
 
 		 652 aa  99  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  27.39 
 
 		 709 aa  99  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  28.12 
 
 		 678 aa  98.2  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  31.77 
 
 		 647 aa  97.8  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  31.42 
 
 		 650 aa  97.8  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  40.14 
 
 		 663 aa  97.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 		 179 aa  97.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  31.42 
 
 		 650 aa  96.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0877  hypothetical protein  61.97 
 
 		 185 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.704927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  30.9 
 
 		 657 aa  95.5  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  35.03 
 
 		 643 aa  95.1  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  38.13 
 
 		 187 aa  95.5  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  35.33 
 
 		 650 aa  95.5  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  26.93 
 
 		 719 aa  94.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 643 aa  94.7  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  39.44 
 
 		 735 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  31.7 
 
 		 642 aa  94.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>