More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0150 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 649 aa  1280    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  54.84 
 
 		 677 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  54.19 
 
 		 653 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  52.09 
 
 		 680 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 649 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  45.79 
 
 		 655 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  46.84 
 
 		 716 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 804 aa  330  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 		 664 aa  313  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.46 
 
 		 652 aa  292  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  37.28 
 
 		 685 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  35.52 
 
 		 691 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 		 691 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  35.91 
 
 		 712 aa  283  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 747 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  35.44 
 
 		 680 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 757 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  34.2 
 
 		 760 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  35.89 
 
 		 685 aa  280  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  33.6 
 
 		 686 aa  280  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  34.64 
 
 		 726 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  36.14 
 
 		 709 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  33.92 
 
 		 749 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  34.89 
 
 		 745 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  29.95 
 
 		 654 aa  266  5.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  33.02 
 
 		 768 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  33.81 
 
 		 735 aa  264  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  33.49 
 
 		 747 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  32.7 
 
 		 746 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  32.74 
 
 		 772 aa  253  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  33.7 
 
 		 774 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  34.76 
 
 		 776 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 		 774 aa  251  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  33.45 
 
 		 788 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  31.27 
 
 		 723 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  32.84 
 
 		 679 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.83 
 
 		 682 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  30.79 
 
 		 747 aa  198  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  30.51 
 
 		 672 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  31.12 
 
 		 677 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.87 
 
 		 616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  30.19 
 
 		 590 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  29.88 
 
 		 808 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  35.23 
 
 		 643 aa  127  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  32.45 
 
 		 650 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  32.68 
 
 		 657 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  32.68 
 
 		 649 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 		 642 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.1 
 
 		 642 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  31.15 
 
 		 660 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  33.79 
 
 		 642 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  33.79 
 
 		 642 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  31.1 
 
 		 642 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 		 677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  32.57 
 
 		 716 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  44.68 
 
 		 638 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  31.88 
 
 		 657 aa  111  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  27.42 
 
 		 739 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  26.47 
 
 		 735 aa  109  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  45.67 
 
 		 374 aa  109  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  31.68 
 
 		 576 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  31.37 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  30.84 
 
 		 663 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 		 643 aa  108  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  33.7 
 
 		 574 aa  108  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 		 650 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  29.72 
 
 		 659 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 642 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  30.14 
 
 		 593 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.14 
 
 		 593 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.38 
 
 		 663 aa  107  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 		 686 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.31 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  31.37 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  28.12 
 
 		 724 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  39.72 
 
 		 645 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  42.66 
 
 		 661 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  29.84 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  28.62 
 
 		 730 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  41.35 
 
 		 643 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  28.98 
 
 		 730 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  31.1 
 
 		 592 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 649 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  30.82 
 
 		 645 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  30.82 
 
 		 645 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  30.82 
 
 		 645 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  40.3 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  31.65 
 
 		 654 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  38.07 
 
 		 681 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  41.33 
 
 		 637 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  25 
 
 		 706 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>