More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0267 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 574 aa  1128    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  39.14 
 
 		 616 aa  340  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 590 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  35.65 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  37.37 
 
 		 588 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1286  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 668 aa  174  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  41.09 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  36.23 
 
 		 679 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 757 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.28 
 
 		 661 aa  120  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 		 804 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 788 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  33.53 
 
 		 664 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  34.97 
 
 		 649 aa  114  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  32.46 
 
 		 774 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  32.46 
 
 		 774 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 776 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  31.55 
 
 		 649 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  33.73 
 
 		 691 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  30.13 
 
 		 760 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 691 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  31.83 
 
 		 649 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  39.43 
 
 		 644 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  31.44 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  33.42 
 
 		 808 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  32.99 
 
 		 657 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  30.8 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  30.57 
 
 		 653 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  30.57 
 
 		 677 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 		 641 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  31.54 
 
 		 642 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  32.94 
 
 		 709 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  37.14 
 
 		 643 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 		 649 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  32.13 
 
 		 685 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.13 
 
 		 652 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  40.62 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  31.21 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  43.45 
 
 		 748 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.33 
 
 		 682 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.57 
 
 		 669 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 		 660 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31 
 
 		 672 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 642 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 685 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  33.46 
 
 		 661 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  34.66 
 
 		 730 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  31.72 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  34.66 
 
 		 730 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 		 747 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 645 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 645 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  32.72 
 
 		 647 aa  98.2  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 645 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  30.64 
 
 		 643 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 645 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  29.91 
 
 		 655 aa  98.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 645 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 729 aa  97.8  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  29.86 
 
 		 735 aa  98.2  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 650 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  30.61 
 
 		 746 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 643 aa  97.1  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  33.22 
 
 		 680 aa  97.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 641 aa  97.1  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.99 
 
 		 642 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  32.65 
 
 		 642 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  27.95 
 
 		 663 aa  96.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  41.67 
 
 		 690 aa  96.3  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  29.49 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  29.49 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  29.49 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  30.32 
 
 		 641 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  46.2 
 
 		 677 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 641 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  30.55 
 
 		 653 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  42.86 
 
 		 677 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 642 aa  94.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  28.57 
 
 		 648 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 		 650 aa  94.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  30.22 
 
 		 640 aa  94  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  29.48 
 
 		 749 aa  93.6  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  41.98 
 
 		 638 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  31.55 
 
 		 712 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  31.64 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  29.76 
 
 		 643 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  31.23 
 
 		 643 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.3 
 
 		 644 aa  92  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  31.7 
 
 		 645 aa  91.3  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  30.03 
 
 		 768 aa  91.3  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  30.7 
 
 		 686 aa  90.9  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  33.68 
 
 		 678 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  33.91 
 
 		 693 aa  90.9  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 		 645 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  37.88 
 
 		 645 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 		 645 aa  90.5  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  37.88 
 
 		 645 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>