More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3087 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 726 aa  1450    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  40.3 
 
 		 804 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  38.12 
 
 		 686 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  36.4 
 
 		 685 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 691 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.04 
 
 		 652 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  37.09 
 
 		 691 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  37.67 
 
 		 685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 757 aa  327  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 712 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 760 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  37.14 
 
 		 709 aa  313  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  35.89 
 
 		 664 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  36.72 
 
 		 788 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 680 aa  306  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 		 677 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  38.45 
 
 		 653 aa  301  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 		 746 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 		 774 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  34.89 
 
 		 735 aa  299  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  35.88 
 
 		 774 aa  298  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  34.29 
 
 		 768 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  35.19 
 
 		 749 aa  292  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  35.19 
 
 		 747 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  37.2 
 
 		 776 aa  291  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  31.98 
 
 		 654 aa  291  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  37.19 
 
 		 680 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 747 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  33.2 
 
 		 745 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 649 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  33.07 
 
 		 772 aa  270  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  35.28 
 
 		 649 aa  269  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  34.73 
 
 		 655 aa  259  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 723 aa  253  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 		 679 aa  243  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 747 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  35.63 
 
 		 716 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  34.32 
 
 		 682 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 672 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 		 673 aa  210  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  34.67 
 
 		 677 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  32.55 
 
 		 616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  35.76 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  35.55 
 
 		 650 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  34.44 
 
 		 653 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  31.42 
 
 		 715 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  27.43 
 
 		 663 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 607 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  34.08 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 655 aa  125  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  26.24 
 
 		 808 aa  125  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  35.31 
 
 		 657 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 650 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 650 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  42.86 
 
 		 678 aa  123  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 652 aa  123  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  34.33 
 
 		 655 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  33.23 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  34.27 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 628 aa  120  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  30.22 
 
 		 735 aa  120  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  34.11 
 
 		 651 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  34.11 
 
 		 651 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  32.68 
 
 		 650 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  34.11 
 
 		 651 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 		 663 aa  120  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  34.11 
 
 		 651 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  34.11 
 
 		 651 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  34.11 
 
 		 651 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  33.88 
 
 		 655 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  34.65 
 
 		 643 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  34.11 
 
 		 651 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  34.33 
 
 		 651 aa  119  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.94 
 
 		 669 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 660 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  32.79 
 
 		 642 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.79 
 
 		 642 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 653 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 690 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 642 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  31.91 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  29.67 
 
 		 739 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 		 590 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 649 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.18 
 
 		 638 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  32.32 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  34.01 
 
 		 654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  32.13 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  44.68 
 
 		 660 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  32.14 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  33.22 
 
 		 693 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 643 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  32.14 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  32.21 
 
 		 645 aa  111  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  32.21 
 
 		 645 aa  111  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  31.44 
 
 		 639 aa  111  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  32.21 
 
 		 645 aa  111  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  31.44 
 
 		 639 aa  111  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  31.44 
 
 		 639 aa  111  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>