More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2697 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 745 aa  1493    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  66.67 
 
 		 735 aa  956    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  76.64 
 
 		 747 aa  1134    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  69.57 
 
 		 747 aa  984    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  67.97 
 
 		 768 aa  995    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  77.32 
 
 		 746 aa  1129    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  69.14 
 
 		 749 aa  962    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  48.5 
 
 		 760 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  46.82 
 
 		 757 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  47.42 
 
 		 772 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  47.03 
 
 		 788 aa  505  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  46.84 
 
 		 776 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  45.29 
 
 		 774 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  44.69 
 
 		 774 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 		 723 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  45.41 
 
 		 747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  37.16 
 
 		 804 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  39.16 
 
 		 691 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  38.72 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  40.59 
 
 		 709 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  36.55 
 
 		 685 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  40.64 
 
 		 685 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 712 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.31 
 
 		 652 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  39.64 
 
 		 680 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  35.79 
 
 		 654 aa  346  7e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  33.44 
 
 		 686 aa  315  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 		 649 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 664 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  35.66 
 
 		 726 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  35.46 
 
 		 680 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  37.17 
 
 		 653 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  34.27 
 
 		 655 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  34.89 
 
 		 649 aa  271  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 		 677 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  33.17 
 
 		 679 aa  249  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.3 
 
 		 672 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 682 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  33.23 
 
 		 716 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  30.81 
 
 		 677 aa  170  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  28.97 
 
 		 673 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  27.79 
 
 		 715 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  39.23 
 
 		 374 aa  104  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  27.38 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  27.38 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  29.18 
 
 		 616 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  25.49 
 
 		 808 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0877  hypothetical protein  62.5 
 
 		 185 aa  101  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.704927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 721 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  27.99 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  37.82 
 
 		 648 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  31.37 
 
 		 690 aa  99.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  30.29 
 
 		 719 aa  99  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.95 
 
 		 663 aa  97.4  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  29.39 
 
 		 654 aa  97.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 690 aa  97.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  29.8 
 
 		 649 aa  94.7  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  27.94 
 
 		 724 aa  94.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.84 
 
 		 645 aa  94  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  26.81 
 
 		 731 aa  94  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  28.28 
 
 		 643 aa  93.6  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  36.23 
 
 		 709 aa  94  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  27.87 
 
 		 716 aa  94  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  36.31 
 
 		 678 aa  93.2  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  29.8 
 
 		 649 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  31.29 
 
 		 686 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  35.86 
 
 		 645 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  26.65 
 
 		 729 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 647 aa  93.2  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  36.3 
 
 		 638 aa  92  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  36.24 
 
 		 556 aa  91.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 709 aa  91.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 659 aa  91.3  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  29.66 
 
 		 590 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  28.37 
 
 		 730 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 735 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  35.71 
 
 		 187 aa  90.1  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  28.48 
 
 		 698 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  36.18 
 
 		 648 aa  89.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  28.12 
 
 		 677 aa  89.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 645 aa  88.6  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 641 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  35.14 
 
 		 641 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  35.42 
 
 		 739 aa  88.2  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 641 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 641 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 641 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.36 
 
 		 669 aa  87.8  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  33.95 
 
 		 639 aa  87.4  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  33.95 
 
 		 639 aa  87.4  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  33.95 
 
 		 639 aa  87.4  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  34.33 
 
 		 649 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3877  lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 		 898 aa  87  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  34.46 
 
 		 641 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  28.72 
 
 		 628 aa  87  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  27.36 
 
 		 720 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 645 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 645 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  26.19 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  38.51 
 
 		 660 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>