More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3701 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
730 aa  1477    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  99.18 
 
 
730 aa  1464    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  48.3 
 
 
731 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  50.3 
 
 
720 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  57.89 
 
 
724 aa  820    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 
729 aa  628  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  49.11 
 
 
735 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  37.13 
 
 
690 aa  365  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  27.57 
 
 
677 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  24.56 
 
 
681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  28.01 
 
 
833 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  29.97 
 
 
777 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 
659 aa  131  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  29.58 
 
 
642 aa  130  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.75 
 
 
748 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  30.05 
 
 
782 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  30.19 
 
 
709 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  26.39 
 
 
756 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  30.52 
 
 
709 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  43.71 
 
 
693 aa  124  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  22.34 
 
 
700 aa  124  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
719 aa  124  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  39.08 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  38.56 
 
 
179 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  39.08 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.34 
 
 
747 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 
798 aa  121  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  30.42 
 
 
715 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  27.93 
 
 
648 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  36.75 
 
 
721 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 
800 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  36.71 
 
 
190 aa  119  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 
663 aa  118  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  39.44 
 
 
663 aa  117  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  41.33 
 
 
645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  34.02 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  42 
 
 
657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 
660 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  41.29 
 
 
648 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  34.02 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  34.02 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 
193 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  34.02 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  34.02 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  34.02 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 
649 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  41.45 
 
 
641 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  34.02 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  34.02 
 
 
645 aa  115  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  41.55 
 
 
661 aa  115  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  37.5 
 
 
187 aa  115  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 
201 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 
199 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 
788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  25.45 
 
 
716 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  38.29 
 
 
653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 
637 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  29.6 
 
 
776 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.52 
 
 
644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  34.92 
 
 
678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 
590 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  27.38 
 
 
750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.67 
 
 
661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  40.79 
 
 
642 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  29.02 
 
 
774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  29.02 
 
 
774 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  34.39 
 
 
654 aa  112  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  30.84 
 
 
760 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  34.21 
 
 
603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  27.15 
 
 
750 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 
676 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
187 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  39.16 
 
 
651 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  42.76 
 
 
643 aa  111  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  39.16 
 
 
651 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  39.16 
 
 
651 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 
651 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 
651 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 
651 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 
650 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  40.28 
 
 
649 aa  111  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 
651 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  27.75 
 
 
698 aa  111  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  34.07 
 
 
645 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  34.07 
 
 
645 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  34.1 
 
 
645 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  34.1 
 
 
645 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  34.07 
 
 
645 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 
650 aa  111  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 
650 aa  111  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.28 
 
 
649 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  33.7 
 
 
645 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  38.56 
 
 
650 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.13 
 
 
642 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  37.8 
 
 
651 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 
757 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 
647 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 
650 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>