More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0034 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 649 aa  1300    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  47.04 
 
 		 655 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  50.34 
 
 		 649 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  47.39 
 
 		 680 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  47.22 
 
 		 653 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 		 677 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 716 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  34.49 
 
 		 664 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  34.39 
 
 		 749 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  34.6 
 
 		 746 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  35.29 
 
 		 735 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  33.12 
 
 		 768 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  33.39 
 
 		 804 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 747 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  34.35 
 
 		 747 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 686 aa  296  9e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  34.49 
 
 		 745 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  33.23 
 
 		 760 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  35.28 
 
 		 726 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.23 
 
 		 652 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  34.05 
 
 		 685 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  33.81 
 
 		 788 aa  273  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  32.54 
 
 		 757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  33.6 
 
 		 776 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 		 712 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  32.39 
 
 		 774 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  32.38 
 
 		 774 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  31.61 
 
 		 772 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  33.28 
 
 		 680 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  32.97 
 
 		 709 aa  253  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  32.22 
 
 		 723 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  29.27 
 
 		 654 aa  252  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  34.07 
 
 		 747 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  32.13 
 
 		 685 aa  240  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  30.27 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  30.34 
 
 		 691 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  32.79 
 
 		 679 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 672 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 682 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  30.51 
 
 		 673 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  29.5 
 
 		 677 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.11 
 
 		 654 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  45.04 
 
 		 645 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  43.36 
 
 		 638 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  30.57 
 
 		 721 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  44.37 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 647 aa  115  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  29.24 
 
 		 808 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  42.07 
 
 		 649 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  29.94 
 
 		 643 aa  114  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  28.83 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  28.83 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  29.04 
 
 		 678 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  30.59 
 
 		 642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.81 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  32.78 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  25.82 
 
 		 709 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  25.52 
 
 		 709 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  41.26 
 
 		 641 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 		 690 aa  110  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.56 
 
 		 641 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.01 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  31.27 
 
 		 719 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  27.33 
 
 		 650 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  29.43 
 
 		 628 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  28.4 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 		 590 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 655 aa  108  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  29.49 
 
 		 660 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  41.04 
 
 		 637 aa  108  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  40.56 
 
 		 641 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 677 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  40.28 
 
 		 643 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 659 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  40.13 
 
 		 669 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  41.04 
 
 		 642 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 641 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 641 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  38.41 
 
 		 698 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  39.86 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 655 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  28.7 
 
 		 592 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  28.83 
 
 		 652 aa  105  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  27.13 
 
 		 657 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  30.87 
 
 		 655 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  37.16 
 
 		 642 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  26.95 
 
 		 644 aa  103  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  27.13 
 
 		 649 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  28.76 
 
 		 576 aa  103  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.33 
 
 		 716 aa  103  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  32.3 
 
 		 661 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  29.31 
 
 		 648 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  36.05 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>