More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1377 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  54.4 
 
 		 747 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 719 aa  1450    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  45.43 
 
 		 715 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  43.4 
 
 		 709 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  43.5 
 
 		 709 aa  545  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 721 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  37.34 
 
 		 698 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  27.78 
 
 		 730 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  27.62 
 
 		 798 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  30.29 
 
 		 748 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  30.76 
 
 		 756 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 750 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  29.29 
 
 		 750 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  28.93 
 
 		 750 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  25.51 
 
 		 797 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  35.16 
 
 		 678 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 		 661 aa  130  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  32.21 
 
 		 663 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  35.41 
 
 		 690 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  29.84 
 
 		 729 aa  127  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  32.99 
 
 		 690 aa  126  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 730 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 730 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.8 
 
 		 654 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.95 
 
 		 673 aa  122  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 804 aa  122  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 782 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  33.44 
 
 		 650 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  33.44 
 
 		 651 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 		 650 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  41.98 
 
 		 187 aa  120  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  33.11 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  33.11 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  33.11 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  27.07 
 
 		 777 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  33.11 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  33.11 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  31.48 
 
 		 655 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  33.11 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  33.11 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.8 
 
 		 731 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  33.45 
 
 		 607 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  27.35 
 
 		 686 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  32.9 
 
 		 650 aa  118  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  31.87 
 
 		 677 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  31.6 
 
 		 655 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 650 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 650 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 650 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  31.96 
 
 		 657 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  35.55 
 
 		 663 aa  117  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  31.55 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  33.66 
 
 		 735 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  31.55 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.76 
 
 		 638 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  31.55 
 
 		 641 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  30.03 
 
 		 660 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  31.55 
 
 		 641 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  31.55 
 
 		 641 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 		 197 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  28.7 
 
 		 724 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  32.41 
 
 		 647 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  29.61 
 
 		 649 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  31.11 
 
 		 643 aa  114  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 653 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.22 
 
 		 669 aa  114  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  29.45 
 
 		 661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  32.03 
 
 		 650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.88 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  28.1 
 
 		 720 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  31.88 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  44.16 
 
 		 677 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  30.13 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  30.13 
 
 		 649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  31.88 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.24 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  31.6 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 653 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  30.41 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  32.78 
 
 		 643 aa  112  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  31.33 
 
 		 641 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 		 641 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 657 aa  112  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  38.99 
 
 		 195 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  33.55 
 
 		 749 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 187 aa  111  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  38.46 
 
 		 681 aa  111  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  31.55 
 
 		 686 aa  110  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.47 
 
 		 603 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  33.01 
 
 		 657 aa  110  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 		 201 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  28.96 
 
 		 660 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  36.79 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  32.36 
 
 		 747 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  31.29 
 
 		 576 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 747 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  29.71 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  35.86 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>