More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1624 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  92.79 
 
 		 709 aa  1327    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 709 aa  1447    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  49.07 
 
 		 715 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  43.31 
 
 		 719 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42 
 
 		 747 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  38.57 
 
 		 721 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  34.28 
 
 		 698 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  34.99 
 
 		 750 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  34.56 
 
 		 750 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  27.25 
 
 		 798 aa  177  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 750 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  27.52 
 
 		 730 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  27.82 
 
 		 756 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  33.04 
 
 		 729 aa  138  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.6 
 
 		 731 aa  137  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  26.62 
 
 		 748 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  23.75 
 
 		 797 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  26.78 
 
 		 690 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  33.92 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 641 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  30.52 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  30.52 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  29.78 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  30.57 
 
 		 661 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  29.97 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  29.97 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  29.97 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  29.97 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  29.97 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  29.97 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  30.59 
 
 		 724 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  29.97 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  29.54 
 
 		 650 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  29.97 
 
 		 651 aa  124  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  29.54 
 
 		 650 aa  124  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  31.49 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  37.89 
 
 		 739 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  31.87 
 
 		 654 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  27.1 
 
 		 735 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  42.67 
 
 		 649 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  29.93 
 
 		 720 aa  120  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  32.04 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  28.16 
 
 		 650 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  28.12 
 
 		 607 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  32.04 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  32.04 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  41.33 
 
 		 642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  40.67 
 
 		 642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  30.7 
 
 		 690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  28.08 
 
 		 655 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  27.78 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  27.78 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 660 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  42 
 
 		 642 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  27.78 
 
 		 650 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  31.69 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  31.69 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  31.69 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  31.69 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  31.69 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  32.11 
 
 		 776 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  31.69 
 
 		 645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  31.86 
 
 		 678 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  31.12 
 
 		 647 aa  118  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  40.67 
 
 		 650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  28.1 
 
 		 650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  27.83 
 
 		 650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  38.6 
 
 		 593 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  31.05 
 
 		 641 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  32.24 
 
 		 788 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  34.76 
 
 		 642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  34.76 
 
 		 642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  31.31 
 
 		 644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  30.03 
 
 		 735 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  38.6 
 
 		 593 aa  115  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  28.23 
 
 		 642 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  39.51 
 
 		 190 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  36.7 
 
 		 647 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  28.45 
 
 		 763 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 637 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  33.67 
 
 		 661 aa  114  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  32.04 
 
 		 645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  26.9 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 		 774 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  43.51 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  32.04 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  28.94 
 
 		 653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  27.64 
 
 		 706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  32.04 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  31.41 
 
 		 760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  32.04 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  31.84 
 
 		 643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  32.04 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  39.6 
 
 		 717 aa  112  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.81 
 
 		 663 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  28.28 
 
 		 657 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  27.01 
 
 		 673 aa  112  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  29.45 
 
 		 661 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>