More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5914 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 797 aa  1617    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  32.51 
 
 		 750 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  35.21 
 
 		 756 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  32.32 
 
 		 750 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  32.95 
 
 		 750 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  26.46 
 
 		 715 aa  184  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  32.74 
 
 		 730 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 		 748 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  24.3 
 
 		 747 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  23.75 
 
 		 709 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  25.54 
 
 		 719 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  28.49 
 
 		 709 aa  131  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  24.36 
 
 		 721 aa  119  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  25.84 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  23.88 
 
 		 698 aa  114  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  29.36 
 
 		 716 aa  114  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  41.29 
 
 		 669 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  25.55 
 
 		 731 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  27.08 
 
 		 798 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  36.94 
 
 		 688 aa  105  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  23.62 
 
 		 730 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  40.79 
 
 		 677 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  29.45 
 
 		 576 aa  99  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  38.67 
 
 		 650 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  29.94 
 
 		 700 aa  98.2  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  27.08 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  23.4 
 
 		 730 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38 
 
 		 642 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  24.15 
 
 		 729 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  36.42 
 
 		 660 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  37.33 
 
 		 642 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  25.51 
 
 		 724 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  27.99 
 
 		 661 aa  94  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  37.33 
 
 		 657 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 643 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  37.33 
 
 		 649 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 		 641 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  37.09 
 
 		 642 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  25.59 
 
 		 690 aa  91.3  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  27.41 
 
 		 686 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  39.38 
 
 		 716 aa  90.5  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  27.16 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  27.16 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 197 aa  89.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  35.4 
 
 		 645 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 645 aa  89  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 645 aa  89  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 645 aa  89  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 645 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 763 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 645 aa  89  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  35.4 
 
 		 645 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  35.37 
 
 		 830 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 645 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  35.4 
 
 		 645 aa  89  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 763 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  37.35 
 
 		 677 aa  88.6  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  24.66 
 
 		 661 aa  88.2  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  35.33 
 
 		 642 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  35.33 
 
 		 642 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  31.36 
 
 		 643 aa  85.9  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  28.07 
 
 		 654 aa  85.9  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  26.46 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  34.87 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  36.73 
 
 		 681 aa  84.7  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2210  lytic transglycosylase catalytic  40.23 
 
 		 725 aa  84.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847947  normal  0.0413346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 664 aa  84  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  26.14 
 
 		 655 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  33.13 
 
 		 637 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  32.7 
 
 		 188 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  27.45 
 
 		 650 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  32.93 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 199 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  24.87 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  32.93 
 
 		 644 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  33.97 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  32.74 
 
 		 643 aa  82  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  27.47 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  27.47 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  27.47 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  27.47 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  27.47 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  27.47 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  27.47 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  26.93 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  32.89 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 645 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  29 
 
 		 655 aa  80.9  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  33.77 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 645 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 645 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 616 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 645 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 645 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 649 aa  79.7  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  31.45 
 
 		 649 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  37.06 
 
 		 673 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  27.86 
 
 		 788 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>