More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2068 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  100 
 
 		 700 aa  1406    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  54.31 
 
 		 681 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  47.29 
 
 		 677 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  29.13 
 
 		 690 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  25.45 
 
 		 720 aa  170  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  25.97 
 
 		 729 aa  152  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  24.8 
 
 		 731 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  26.42 
 
 		 735 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  22.8 
 
 		 730 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  22.64 
 
 		 730 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  23.45 
 
 		 724 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  27.95 
 
 		 715 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  30.68 
 
 		 716 aa  112  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 698 aa  108  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  38.27 
 
 		 654 aa  107  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.69 
 
 		 669 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  28.18 
 
 		 628 aa  105  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  31.16 
 
 		 677 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 		 603 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  29.52 
 
 		 637 aa  103  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  29.26 
 
 		 672 aa  101  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 660 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  29.97 
 
 		 760 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  24 
 
 		 709 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  29.97 
 
 		 647 aa  100  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  28.31 
 
 		 643 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 		 686 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 721 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.67 
 
 		 747 aa  99.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 719 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  30.85 
 
 		 707 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  29.94 
 
 		 797 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  30.83 
 
 		 678 aa  99  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  31.61 
 
 		 757 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  28.89 
 
 		 652 aa  98.2  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 195 aa  98.2  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  42.66 
 
 		 643 aa  98.2  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  26.94 
 
 		 661 aa  98.2  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  29.84 
 
 		 776 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  29.74 
 
 		 774 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  30.1 
 
 		 661 aa  97.8  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  29.74 
 
 		 774 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  38.2 
 
 		 690 aa  97.4  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 576 aa  97.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  31.06 
 
 		 663 aa  97.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  26.33 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 660 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 748 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  30.08 
 
 		 693 aa  95.1  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  31 
 
 		 756 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  30.04 
 
 		 657 aa  94.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  27.66 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  27.66 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  27.66 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  22.95 
 
 		 709 aa  94.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  29.47 
 
 		 657 aa  94.4  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  27.66 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  27.66 
 
 		 651 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 650 aa  94.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  27.66 
 
 		 651 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  27.66 
 
 		 651 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  33.91 
 
 		 650 aa  94  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  27.13 
 
 		 651 aa  94  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  29.79 
 
 		 655 aa  93.6  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  39.16 
 
 		 673 aa  92.8  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  35.43 
 
 		 650 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  35.2 
 
 		 641 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  36.14 
 
 		 657 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  36.14 
 
 		 649 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  42.06 
 
 		 642 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  40.6 
 
 		 664 aa  92.4  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 643 aa  92.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 650 aa  92.4  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  42.06 
 
 		 642 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 642 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 590 aa  92.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  28.28 
 
 		 637 aa  91.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 682 aa  91.3  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  42.5 
 
 		 642 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 679 aa  90.5  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  25.2 
 
 		 645 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  25.74 
 
 		 593 aa  90.1  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  26.02 
 
 		 593 aa  90.1  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  25.2 
 
 		 645 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  33.73 
 
 		 607 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  25.2 
 
 		 645 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  35.57 
 
 		 659 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 804 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.18 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  38.13 
 
 		 788 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  37.12 
 
 		 649 aa  89.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  33.33 
 
 		 655 aa  89.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  28.52 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  38.41 
 
 		 616 aa  89  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  25 
 
 		 645 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  31.79 
 
 		 644 aa  88.6  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  27.82 
 
 		 671 aa  88.6  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 645 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  27.81 
 
 		 650 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>