More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4220 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
735 aa  1466    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  45.52 
 
 
720 aa  628  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  49.12 
 
 
730 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  49.11 
 
 
730 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  45.17 
 
 
724 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  43.82 
 
 
731 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  43.99 
 
 
729 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  37.61 
 
 
690 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  28.97 
 
 
677 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  28.62 
 
 
681 aa  162  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  27.38 
 
 
700 aa  144  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  43.79 
 
 
179 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  25.62 
 
 
715 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  30.19 
 
 
651 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  30.19 
 
 
651 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  30.19 
 
 
651 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  30.19 
 
 
651 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  30.19 
 
 
651 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  30.19 
 
 
651 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  30.19 
 
 
651 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  29.33 
 
 
651 aa  125  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  41.18 
 
 
187 aa  124  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  38.56 
 
 
201 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  39.35 
 
 
193 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  30.22 
 
 
650 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  43.14 
 
 
833 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  29.6 
 
 
650 aa  121  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  29.6 
 
 
650 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  30.31 
 
 
650 aa  121  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  30.31 
 
 
650 aa  121  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  29.6 
 
 
650 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  41.83 
 
 
777 aa  120  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  29.28 
 
 
607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  44.06 
 
 
663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  40.25 
 
 
659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
199 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
693 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
748 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 
671 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  39.88 
 
 
798 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
660 aa  115  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 
782 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 
657 aa  115  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 
657 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  40.56 
 
 
739 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  41.29 
 
 
663 aa  115  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 
800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  30.03 
 
 
709 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 
195 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.76 
 
 
747 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  29.93 
 
 
717 aa  114  8.000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  28.74 
 
 
709 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  41.45 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  41.03 
 
 
678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 
735 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  39.16 
 
 
690 aa  113  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 
187 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  39.49 
 
 
653 aa  111  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  30.86 
 
 
655 aa  111  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  41.33 
 
 
642 aa  111  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  29.34 
 
 
698 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  35.25 
 
 
650 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  30.53 
 
 
655 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  28.48 
 
 
655 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  41.01 
 
 
195 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  34.84 
 
 
650 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  36.13 
 
 
654 aa  108  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  39.49 
 
 
707 aa  108  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  29.11 
 
 
628 aa  108  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  37.01 
 
 
181 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  29.18 
 
 
750 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  42.25 
 
 
661 aa  108  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  42.14 
 
 
676 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 
706 aa  107  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  27.85 
 
 
652 aa  107  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  29.18 
 
 
750 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  31.49 
 
 
653 aa  107  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  36.36 
 
 
181 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 
645 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  30.47 
 
 
650 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 
645 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 
645 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 
645 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 
645 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  39.88 
 
 
590 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  42.96 
 
 
643 aa  105  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.87 
 
 
642 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  28.91 
 
 
756 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  39.24 
 
 
650 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  38.12 
 
 
644 aa  104  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 
641 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 
660 aa  104  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  34.76 
 
 
647 aa  104  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 
219 aa  104  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  37.36 
 
 
750 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  35.88 
 
 
645 aa  103  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 
645 aa  103  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  35.88 
 
 
645 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 
645 aa  103  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 
645 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>