More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0486 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
748 aa  1465    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  38.39 
 
 
750 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 
750 aa  310  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  38.47 
 
 
750 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  40.88 
 
 
756 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  27.79 
 
 
715 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  28.42 
 
 
721 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.62 
 
 
747 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 
730 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 
797 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  30.35 
 
 
719 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  26.59 
 
 
709 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  32.24 
 
 
782 aa  140  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  29.69 
 
 
709 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  41.4 
 
 
731 aa  134  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 
774 aa  134  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 
776 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 
774 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  27.29 
 
 
798 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  31.99 
 
 
698 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  39.75 
 
 
730 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  39.75 
 
 
730 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.66 
 
 
663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  43.87 
 
 
833 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  39.76 
 
 
729 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  41.54 
 
 
651 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  43.23 
 
 
800 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 
760 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 
651 aa  127  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  41.03 
 
 
651 aa  127  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 
651 aa  127  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 
651 aa  127  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  41.03 
 
 
651 aa  127  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 
651 aa  127  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  41.03 
 
 
651 aa  127  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  41.62 
 
 
650 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.91 
 
 
638 aa  126  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  41.08 
 
 
607 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  41.08 
 
 
650 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  32.93 
 
 
643 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  41.08 
 
 
650 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  41.08 
 
 
650 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  41.08 
 
 
650 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  41.08 
 
 
650 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  28.43 
 
 
593 aa  124  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  28.43 
 
 
593 aa  124  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  38.99 
 
 
724 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  46.79 
 
 
661 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 
757 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  31.55 
 
 
640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  35.02 
 
 
654 aa  120  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  45.39 
 
 
663 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  38.5 
 
 
659 aa  120  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  46.15 
 
 
661 aa  120  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  32.46 
 
 
647 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 
777 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  41.04 
 
 
650 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  45.27 
 
 
657 aa  119  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  45.27 
 
 
657 aa  119  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  45.1 
 
 
187 aa  119  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  40.44 
 
 
660 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.34 
 
 
603 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  34.56 
 
 
648 aa  118  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
735 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  34.94 
 
 
720 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  31.64 
 
 
690 aa  117  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 
657 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 
649 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 
641 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  40.7 
 
 
657 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 
199 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  29.62 
 
 
671 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  40.12 
 
 
642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  41.4 
 
 
660 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.7 
 
 
642 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  31.38 
 
 
645 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  40 
 
 
655 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  33.5 
 
 
763 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  40.7 
 
 
650 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  39.88 
 
 
642 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  33.76 
 
 
763 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 
653 aa  114  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  33.19 
 
 
688 aa  113  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  44.68 
 
 
650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  42.86 
 
 
669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  46.1 
 
 
642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 
643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  45.1 
 
 
690 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  31.2 
 
 
661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  43.92 
 
 
678 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 
707 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  43.06 
 
 
649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 
655 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  40.91 
 
 
642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  40.91 
 
 
642 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  31.71 
 
 
677 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
649 aa  112  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 
788 aa  112  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  29.93 
 
 
644 aa  112  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>