More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4098 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 590 aa  1163    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  44.2 
 
 		 592 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  46.61 
 
 		 588 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  33.22 
 
 		 616 aa  224  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  34.53 
 
 		 574 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1286  Lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 		 668 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 608 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  33.07 
 
 		 499 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  30.35 
 
 		 649 aa  133  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  30.86 
 
 		 653 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 677 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  31.9 
 
 		 680 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  33.52 
 
 		 804 aa  127  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  33.26 
 
 		 760 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  31.12 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  39.2 
 
 		 731 aa  117  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 772 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 788 aa  114  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 730 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 730 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  38.86 
 
 		 729 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  32.42 
 
 		 808 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  31.27 
 
 		 726 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 672 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.17 
 
 		 682 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  48.92 
 
 		 690 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  35.31 
 
 		 661 aa  107  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 777 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 657 aa  107  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  39.88 
 
 		 735 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 685 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 655 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  28.83 
 
 		 654 aa  104  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 724 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 663 aa  103  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.68 
 
 		 654 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  44.85 
 
 		 748 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  29.12 
 
 		 664 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 		 649 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  31.02 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  32.11 
 
 		 680 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 776 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 774 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 774 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 673 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  38.22 
 
 		 798 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  40.66 
 
 		 660 aa  100  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  33.68 
 
 		 677 aa  100  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  30.52 
 
 		 715 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  31.99 
 
 		 671 aa  98.6  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  29 
 
 		 747 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  30.62 
 
 		 655 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  43.42 
 
 		 187 aa  98.2  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  40.98 
 
 		 693 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  44.7 
 
 		 638 aa  97.8  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  42.41 
 
 		 800 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  32.7 
 
 		 833 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  38.96 
 
 		 603 aa  97.4  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 644 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 716 aa  96.3  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  32.24 
 
 		 642 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  33.69 
 
 		 643 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  47.62 
 
 		 721 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  41.33 
 
 		 642 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  42.67 
 
 		 641 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  46.51 
 
 		 649 aa  94.7  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  42.04 
 
 		 650 aa  95.1  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  46.51 
 
 		 649 aa  94.4  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  41.4 
 
 		 650 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 644 aa  94.7  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  39.24 
 
 		 653 aa  94.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  30.83 
 
 		 651 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  30.83 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  39.43 
 
 		 650 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  30.83 
 
 		 651 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  30.83 
 
 		 651 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  30.83 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  30.83 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  30.83 
 
 		 651 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  40.24 
 
 		 650 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  40.24 
 
 		 650 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  28.94 
 
 		 735 aa  94  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  41.07 
 
 		 650 aa  94  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  30.24 
 
 		 712 aa  93.6  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.03 
 
 		 652 aa  93.2  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  39.46 
 
 		 659 aa  93.2  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  42.03 
 
 		 685 aa  93.6  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 723 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  43.07 
 
 		 650 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 		 691 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 607 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  41.86 
 
 		 700 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  39.66 
 
 		 651 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  42 
 
 		 643 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  28.71 
 
 		 768 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 782 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  29.3 
 
 		 746 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  42.06 
 
 		 698 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>