More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2690 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 800 aa  1544    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  74.11 
 
 		 833 aa  1064    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  43.32 
 
 		 782 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  39.28 
 
 		 777 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  46.45 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  34.47 
 
 		 750 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  34.47 
 
 		 750 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  33.23 
 
 		 663 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  43.23 
 
 		 748 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  32.25 
 
 		 671 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 657 aa  127  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 657 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  34.1 
 
 		 750 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  28.02 
 
 		 715 aa  125  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 647 aa  124  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  35.5 
 
 		 661 aa  120  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 		 707 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  44 
 
 		 661 aa  120  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 730 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  28.06 
 
 		 798 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 730 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  29.31 
 
 		 729 aa  120  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 		 660 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 650 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 650 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  27.02 
 
 		 724 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  36.71 
 
 		 654 aa  117  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  39.19 
 
 		 693 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  40.62 
 
 		 187 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  34.76 
 
 		 653 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 		 735 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  34.57 
 
 		 678 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.41 
 
 		 649 aa  114  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  34.47 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  34.41 
 
 		 649 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.49 
 
 		 731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  32.09 
 
 		 690 aa  113  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  24.23 
 
 		 720 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  30.95 
 
 		 690 aa  113  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.44 
 
 		 747 aa  111  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  37.36 
 
 		 688 aa  111  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  42.86 
 
 		 830 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 730 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 763 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 763 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  33.47 
 
 		 676 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 		 199 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  33.99 
 
 		 201 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 663 aa  108  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  32.59 
 
 		 655 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  25.93 
 
 		 719 aa  107  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  29.84 
 
 		 642 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  28.17 
 
 		 709 aa  107  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  29.78 
 
 		 706 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 653 aa  106  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  34.17 
 
 		 760 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 757 aa  105  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.29 
 
 		 641 aa  103  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 		 195 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 		 650 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 		 616 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  33.73 
 
 		 641 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  30.27 
 
 		 644 aa  101  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  27.93 
 
 		 643 aa  101  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  27.55 
 
 		 709 aa  101  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 641 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  35.67 
 
 		 717 aa  101  7e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 		 774 aa  100  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 641 aa  100  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  37.16 
 
 		 660 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 		 776 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  34.39 
 
 		 181 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 		 774 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 739 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  34.66 
 
 		 641 aa  99.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  32.76 
 
 		 651 aa  99.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 642 aa  99.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  31.09 
 
 		 641 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  32.33 
 
 		 651 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  32.33 
 
 		 651 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  32.33 
 
 		 651 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 607 aa  99  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  31.64 
 
 		 650 aa  99  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  32.33 
 
 		 651 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  32.33 
 
 		 651 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  31.22 
 
 		 788 aa  99  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 643 aa  99.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 647 aa  99  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  32.33 
 
 		 651 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  32.33 
 
 		 651 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 650 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  33.49 
 
 		 735 aa  98.6  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  29.84 
 
 		 716 aa  98.2  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  39.35 
 
 		 182 aa  98.2  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  31.47 
 
 		 650 aa  97.8  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 		 193 aa  98.2  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  31.47 
 
 		 650 aa  97.8  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 642 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>