More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1183 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 588 aa  1163    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  48.87 
 
 		 592 aa  517  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  46.22 
 
 		 590 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 616 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  37.67 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 		 608 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1286  Lytic transglycosylase catalytic  33.76 
 
 		 668 aa  150  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  34.97 
 
 		 499 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  34.07 
 
 		 808 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  31.89 
 
 		 664 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  31.79 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 804 aa  104  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  33.89 
 
 		 671 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  42.76 
 
 		 729 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  31.4 
 
 		 655 aa  102  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  34.52 
 
 		 757 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 726 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  32.93 
 
 		 654 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 731 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  32.07 
 
 		 768 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  30.89 
 
 		 677 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  32.14 
 
 		 735 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  31.06 
 
 		 653 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.05 
 
 		 672 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  31.42 
 
 		 772 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 747 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  31.17 
 
 		 649 aa  96.3  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  31.07 
 
 		 680 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  43.79 
 
 		 187 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 		 724 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  31.49 
 
 		 749 aa  93.6  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  32.62 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  42.96 
 
 		 669 aa  93.6  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  32.83 
 
 		 716 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  30.27 
 
 		 720 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  40.25 
 
 		 641 aa  92  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 		 760 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 730 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 730 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 677 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  31.07 
 
 		 735 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  41.96 
 
 		 763 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  30.65 
 
 		 746 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  31.17 
 
 		 642 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.41 
 
 		 641 aa  88.6  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  41.86 
 
 		 700 aa  88.6  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  38.51 
 
 		 603 aa  88.6  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  42.75 
 
 		 719 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  42.14 
 
 		 763 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  42.14 
 
 		 830 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  30.97 
 
 		 641 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  32.55 
 
 		 709 aa  87  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  31.32 
 
 		 745 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  44.12 
 
 		 661 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  34.84 
 
 		 717 aa  86.7  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  49.23 
 
 		 677 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  30.84 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  31.7 
 
 		 691 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  34.53 
 
 		 661 aa  85.9  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  39.04 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  30.65 
 
 		 747 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  39.04 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  29.34 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.67 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  40.14 
 
 		 690 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 		 691 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  28.91 
 
 		 642 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  26.99 
 
 		 593 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  26.99 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 685 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 782 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.05 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  42.34 
 
 		 647 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 		 777 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  28.19 
 
 		 628 aa  81.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  36.71 
 
 		 798 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  29.35 
 
 		 642 aa  80.9  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.27 
 
 		 716 aa  80.9  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 641 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  27.11 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 649 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  29.19 
 
 		 644 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 641 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 641 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  36.08 
 
 		 641 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  30.05 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 641 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  38.73 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  32.58 
 
 		 663 aa  80.1  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  28.19 
 
 		 652 aa  79.7  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  35.26 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.61 
 
 		 748 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  35.26 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  38.73 
 
 		 637 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  35.26 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  28.45 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  30.06 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>