More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1141 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  54.24 
 
 		 652 aa  686    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  68.46 
 
 		 685 aa  880    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  62.89 
 
 		 709 aa  858    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 691 aa  1389    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  53.93 
 
 		 685 aa  681    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  52.56 
 
 		 712 aa  707    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  94.79 
 
 		 691 aa  1327    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  46.81 
 
 		 654 aa  605  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  53.56 
 
 		 680 aa  601  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  40.29 
 
 		 757 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  41.27 
 
 		 760 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  40.06 
 
 		 788 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  42.43 
 
 		 747 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  38.81 
 
 		 749 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 723 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  39.06 
 
 		 735 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  38.72 
 
 		 745 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 747 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 746 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  38.91 
 
 		 772 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  37.7 
 
 		 768 aa  361  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  38.73 
 
 		 774 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  38.55 
 
 		 774 aa  357  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  38.77 
 
 		 776 aa  357  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  40.25 
 
 		 747 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 804 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  37.15 
 
 		 726 aa  328  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  33.44 
 
 		 686 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  36.06 
 
 		 664 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 		 649 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 677 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  34.79 
 
 		 653 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 655 aa  257  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  36.51 
 
 		 680 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 679 aa  252  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  33.16 
 
 		 672 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  29.79 
 
 		 649 aa  223  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 682 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.39 
 
 		 673 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  33.5 
 
 		 716 aa  200  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 677 aa  171  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 616 aa  127  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.89 
 
 		 686 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  26.12 
 
 		 808 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  31.01 
 
 		 593 aa  121  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.7 
 
 		 593 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.55 
 
 		 669 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  32.11 
 
 		 648 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.91 
 
 		 716 aa  114  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  45.31 
 
 		 374 aa  112  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 677 aa  111  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  43.61 
 
 		 645 aa  111  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  30.26 
 
 		 663 aa  109  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 657 aa  108  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  32.85 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  41.43 
 
 		 638 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  32 
 
 		 678 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 650 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  41.72 
 
 		 690 aa  104  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  28.36 
 
 		 637 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  44.83 
 
 		 643 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.22 
 
 		 649 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  31.23 
 
 		 643 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.22 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  31.52 
 
 		 660 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  30.53 
 
 		 628 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  41.01 
 
 		 748 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 		 715 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  43.42 
 
 		 644 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  41.45 
 
 		 643 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  29.64 
 
 		 653 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  43.42 
 
 		 641 aa  101  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  29.16 
 
 		 642 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  27.46 
 
 		 654 aa  100  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  30.96 
 
 		 750 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  30.84 
 
 		 650 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  30.96 
 
 		 833 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  33.99 
 
 		 657 aa  100  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  36.56 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 639 aa  100  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 		 643 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  28.79 
 
 		 735 aa  99.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 639 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 639 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 		 637 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  29.45 
 
 		 657 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  36 
 
 		 642 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  32.22 
 
 		 750 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  25.3 
 
 		 709 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 642 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  32.22 
 
 		 750 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  31.7 
 
 		 642 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  29.14 
 
 		 659 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  34.86 
 
 		 642 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  34.86 
 
 		 649 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  31.7 
 
 		 642 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  41.91 
 
 		 660 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  29.15 
 
 		 706 aa  98.2  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  41.61 
 
 		 645 aa  97.8  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>