More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1584 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
686 aa  1379    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 
804 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  38.12 
 
 
726 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  35.21 
 
 
788 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  35.2 
 
 
760 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  35.73 
 
 
757 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  34.39 
 
 
709 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  33.43 
 
 
749 aa  321  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  34.42 
 
 
735 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  36.33 
 
 
776 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  34.37 
 
 
768 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 
747 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  32.96 
 
 
654 aa  316  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 
691 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  33.99 
 
 
774 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.05 
 
 
652 aa  312  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  33.83 
 
 
774 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 
712 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  34.1 
 
 
685 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 
746 aa  310  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 
685 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  33.65 
 
 
664 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  33.23 
 
 
747 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  32.63 
 
 
691 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  35.19 
 
 
655 aa  295  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  35.08 
 
 
653 aa  293  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 
745 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  35.24 
 
 
677 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  36.95 
 
 
680 aa  290  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  33.5 
 
 
680 aa  283  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 
649 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  32.33 
 
 
723 aa  275  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  33.18 
 
 
772 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  34.77 
 
 
747 aa  269  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  32.96 
 
 
649 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.22 
 
 
672 aa  261  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 
679 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  33.45 
 
 
682 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  32.51 
 
 
716 aa  205  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.02 
 
 
673 aa  195  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  29.27 
 
 
677 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  31.19 
 
 
808 aa  127  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  33.98 
 
 
678 aa  124  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.43 
 
 
669 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  42.66 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  33.22 
 
 
698 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 
663 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  44.14 
 
 
690 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 
657 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  34.53 
 
 
657 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  42.45 
 
 
645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  29 
 
 
715 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  31.55 
 
 
719 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 
659 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  32.78 
 
 
686 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  31.48 
 
 
642 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 
644 aa  108  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  39.44 
 
 
721 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.05 
 
 
650 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 
660 aa  107  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  39.63 
 
 
663 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  29.29 
 
 
661 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  28.94 
 
 
739 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  26.38 
 
 
593 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  38.67 
 
 
640 aa  104  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  32.34 
 
 
628 aa  104  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  40.6 
 
 
653 aa  104  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 
649 aa  104  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  38.81 
 
 
650 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  26.14 
 
 
593 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 
706 aa  103  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  40.44 
 
 
709 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  29.9 
 
 
616 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 
707 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 
641 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 
641 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  33.44 
 
 
642 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  30.75 
 
 
650 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  31.1 
 
 
655 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  39.86 
 
 
644 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  28.01 
 
 
735 aa  102  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  30.61 
 
 
642 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 
641 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  37.41 
 
 
641 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 
641 aa  101  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 
641 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 
641 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.41 
 
 
641 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 
641 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  31.63 
 
 
642 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  30.09 
 
 
657 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 
643 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  32.01 
 
 
652 aa  100  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  32.3 
 
 
642 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 
641 aa  100  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  31.63 
 
 
642 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 
641 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  31.95 
 
 
643 aa  99.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  29.9 
 
 
650 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  31.42 
 
 
671 aa  99  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>