More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1874 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  64.57 
 
 
739 aa  939    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  65.95 
 
 
735 aa  953    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
706 aa  1464    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  30.98 
 
 
671 aa  253  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  31.48 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  31.48 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  31.48 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  31.48 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  32.17 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  31.48 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  31.48 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  31.48 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  30.56 
 
 
654 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 
650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  30.36 
 
 
650 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  30.36 
 
 
650 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  30.7 
 
 
650 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  31.09 
 
 
650 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  30.64 
 
 
607 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  30.14 
 
 
650 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  29.2 
 
 
657 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  29.12 
 
 
642 aa  231  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  37.03 
 
 
650 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  37.03 
 
 
650 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  29.43 
 
 
657 aa  224  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  39.64 
 
 
650 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  29.35 
 
 
647 aa  220  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  27.85 
 
 
653 aa  216  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  31.03 
 
 
655 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  28.51 
 
 
678 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  28.41 
 
 
644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  34.81 
 
 
628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  37.16 
 
 
655 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  28.09 
 
 
652 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  31.03 
 
 
655 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  29.06 
 
 
660 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  28.68 
 
 
676 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  28.81 
 
 
659 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  27.94 
 
 
707 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  28.59 
 
 
693 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  28.9 
 
 
657 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  35.52 
 
 
653 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  26.89 
 
 
663 aa  194  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  36.24 
 
 
642 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  36.24 
 
 
642 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  33.64 
 
 
663 aa  179  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  26.37 
 
 
690 aa  178  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  28.19 
 
 
643 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 
637 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.54 
 
 
686 aa  173  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  25.43 
 
 
660 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  27.7 
 
 
643 aa  171  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  25.38 
 
 
650 aa  171  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  35.99 
 
 
643 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  32.19 
 
 
642 aa  167  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  27.24 
 
 
647 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  25.5 
 
 
661 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  32.92 
 
 
642 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.11 
 
 
642 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  32.72 
 
 
661 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  32.93 
 
 
716 aa  158  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  31.76 
 
 
576 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
641 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 
649 aa  151  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.05 
 
 
649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  31.56 
 
 
637 aa  148  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  29.69 
 
 
657 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  24.69 
 
 
649 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.6 
 
 
669 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  25.56 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  23.47 
 
 
644 aa  142  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  25.51 
 
 
593 aa  140  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  31.42 
 
 
641 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  31.15 
 
 
641 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  31.42 
 
 
641 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.15 
 
 
641 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  26.7 
 
 
648 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.1 
 
 
645 aa  137  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  24.96 
 
 
648 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  24.64 
 
 
677 aa  130  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  31.37 
 
 
661 aa  130  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  31.66 
 
 
641 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  24.18 
 
 
645 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 
641 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 
641 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 
641 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  31.1 
 
 
641 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 
641 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  24.84 
 
 
645 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  24.84 
 
 
645 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  24.84 
 
 
645 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  25.12 
 
 
645 aa  126  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  25.12 
 
 
645 aa  126  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  25.12 
 
 
645 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  25.12 
 
 
645 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  25.12 
 
 
645 aa  126  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  24.09 
 
 
642 aa  126  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  25.12 
 
 
645 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  24.63 
 
 
645 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  22.78 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>