More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1909 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 677 aa  1307    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  36.39 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  33.49 
 
 		 664 aa  234  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  34.87 
 
 		 680 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  31.03 
 
 		 804 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  32.83 
 
 		 760 aa  209  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 677 aa  207  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  34.86 
 
 		 726 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  34.49 
 
 		 653 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 757 aa  204  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.74 
 
 		 652 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  30.57 
 
 		 685 aa  198  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  38.05 
 
 		 788 aa  194  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  30.27 
 
 		 672 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  31.55 
 
 		 679 aa  193  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  31.17 
 
 		 749 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  29.48 
 
 		 649 aa  191  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  30.28 
 
 		 655 aa  186  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  31.52 
 
 		 691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  29.71 
 
 		 747 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 682 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  29.32 
 
 		 768 aa  183  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  30.8 
 
 		 745 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  31.6 
 
 		 712 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  29.34 
 
 		 747 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 691 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  30.57 
 
 		 735 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  29.6 
 
 		 746 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  35.11 
 
 		 709 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 		 776 aa  176  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  30.31 
 
 		 654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  35.82 
 
 		 774 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  35.75 
 
 		 774 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  30.59 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  31.12 
 
 		 649 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  30.58 
 
 		 685 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  29.2 
 
 		 686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  31.64 
 
 		 747 aa  164  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  29.7 
 
 		 772 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  31.29 
 
 		 716 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  26.06 
 
 		 808 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  35.31 
 
 		 756 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 649 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.52 
 
 		 638 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 616 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  44.37 
 
 		 645 aa  118  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 		 650 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 		 374 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  37.16 
 
 		 669 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  39.31 
 
 		 637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 643 aa  111  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  26.57 
 
 		 637 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  41.13 
 
 		 648 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  40.79 
 
 		 657 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  39.86 
 
 		 641 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 		 639 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  40.79 
 
 		 649 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  39.86 
 
 		 644 aa  109  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 		 639 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 		 639 aa  109  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  40.79 
 
 		 641 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  40.13 
 
 		 650 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  41.06 
 
 		 750 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  41.06 
 
 		 750 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 663 aa  107  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  41.33 
 
 		 750 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  38.85 
 
 		 642 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  37.11 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 645 aa  107  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  37.11 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 		 645 aa  107  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 		 645 aa  107  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 		 645 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  44.22 
 
 		 690 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 		 645 aa  107  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  34.98 
 
 		 641 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.53 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  40.69 
 
 		 748 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 645 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  30.15 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  39.46 
 
 		 643 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  34.53 
 
 		 641 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  38.78 
 
 		 642 aa  104  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  37.84 
 
 		 645 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.13 
 
 		 642 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  39.72 
 
 		 645 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  40.13 
 
 		 642 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  43.08 
 
 		 677 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  40.79 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  37.16 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  37.16 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  41.06 
 
 		 715 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  40.44 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  35.59 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  40.79 
 
 		 642 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>