More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2641 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 833 aa  1622    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  74.11 
 
 		 800 aa  973    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  43.81 
 
 		 782 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 777 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  34.87 
 
 		 750 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  34.64 
 
 		 750 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  47.74 
 
 		 603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  34.42 
 
 		 750 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  28.01 
 
 		 730 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  27.97 
 
 		 730 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 724 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  31.35 
 
 		 748 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  29.57 
 
 		 729 aa  133  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  30.58 
 
 		 798 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  45.27 
 
 		 657 aa  127  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  45.27 
 
 		 657 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  43.92 
 
 		 659 aa  124  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 		 661 aa  124  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  26.64 
 
 		 715 aa  124  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  45.33 
 
 		 707 aa  124  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  35.62 
 
 		 650 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  35.32 
 
 		 650 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  46.71 
 
 		 663 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  43.14 
 
 		 735 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.54 
 
 		 731 aa  120  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  43.33 
 
 		 653 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.31 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 661 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  35.09 
 
 		 647 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  34.57 
 
 		 693 aa  119  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  41.89 
 
 		 660 aa  119  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  41.29 
 
 		 187 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.33 
 
 		 654 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  34.5 
 
 		 671 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.6 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.6 
 
 		 649 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 201 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  40.83 
 
 		 688 aa  115  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  27.81 
 
 		 719 aa  114  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  34.85 
 
 		 706 aa  114  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  30.25 
 
 		 642 aa  114  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  31.07 
 
 		 730 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  43.31 
 
 		 763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  33.76 
 
 		 678 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 676 aa  113  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  43.31 
 
 		 830 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 690 aa  113  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.37 
 
 		 641 aa  112  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  30.77 
 
 		 690 aa  112  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  43.31 
 
 		 763 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  34.67 
 
 		 655 aa  111  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 653 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  36.69 
 
 		 556 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  37.42 
 
 		 709 aa  109  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  32.6 
 
 		 760 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 		 182 aa  108  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 757 aa  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  39.87 
 
 		 739 aa  106  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  31.22 
 
 		 774 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  31.22 
 
 		 776 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  33.76 
 
 		 650 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 735 aa  106  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  35.08 
 
 		 641 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  33.76 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  35.67 
 
 		 181 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  36.6 
 
 		 187 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  35.08 
 
 		 641 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  28.4 
 
 		 709 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 195 aa  105  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  30.94 
 
 		 774 aa  105  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  35.74 
 
 		 641 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  38.92 
 
 		 616 aa  105  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 756 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  35.17 
 
 		 641 aa  104  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  28.62 
 
 		 643 aa  104  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.7 
 
 		 663 aa  104  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 607 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  30.89 
 
 		 655 aa  103  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  33.6 
 
 		 655 aa  103  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  31.29 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  34.84 
 
 		 193 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 244 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 197 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  32.44 
 
 		 628 aa  102  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 721 aa  102  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  35.03 
 
 		 717 aa  102  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  33.74 
 
 		 641 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  33.74 
 
 		 641 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  27.68 
 
 		 747 aa  101  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  33.74 
 
 		 641 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  33.74 
 
 		 641 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  33.74 
 
 		 641 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  38 
 
 		 643 aa  101  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  37.33 
 
 		 642 aa  101  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>