More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2691 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
798 aa  1642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  27.96 
 
 
709 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  26.87 
 
 
721 aa  180  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  27.2 
 
 
709 aa  177  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  26.11 
 
 
715 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  30.53 
 
 
750 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29 
 
 
747 aa  151  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  30.02 
 
 
750 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  30.02 
 
 
750 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  27.62 
 
 
719 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  33.42 
 
 
698 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  31.69 
 
 
756 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  27.94 
 
 
782 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  32.92 
 
 
833 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  27.29 
 
 
748 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  40.24 
 
 
731 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
730 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
730 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  25.68 
 
 
730 aa  120  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  39.38 
 
 
729 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  38.56 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  29.18 
 
 
808 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  39.88 
 
 
735 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  28.57 
 
 
690 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  34.72 
 
 
800 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 
190 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 
199 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  37.25 
 
 
181 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
724 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  36.48 
 
 
201 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  42.17 
 
 
661 aa  114  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
182 aa  114  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  31.6 
 
 
654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  32.48 
 
 
644 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 
720 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  42.95 
 
 
661 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  26.2 
 
 
664 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 
777 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.51 
 
 
197 aa  110  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  27.08 
 
 
797 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  41.89 
 
 
647 aa  108  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 
195 aa  107  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.9 
 
 
603 aa  107  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  41.83 
 
 
678 aa  107  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  37.43 
 
 
693 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 
193 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  35.95 
 
 
187 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  31.23 
 
 
637 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  41.83 
 
 
650 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
650 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
650 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
556 aa  105  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
650 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  36.65 
 
 
663 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 
188 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
650 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  42.38 
 
 
669 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
650 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 
647 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  41.18 
 
 
651 aa  105  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  41.4 
 
 
655 aa  105  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  37.35 
 
 
677 aa  104  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  37.74 
 
 
688 aa  104  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
607 aa  104  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 
639 aa  104  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 
639 aa  104  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  38.51 
 
 
642 aa  104  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 
639 aa  104  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 
651 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  40.52 
 
 
651 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  40.52 
 
 
651 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  40.52 
 
 
651 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 
651 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 
651 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 
651 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  42.97 
 
 
645 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
663 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 
653 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  41.5 
 
 
804 aa  103  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  39.38 
 
 
671 aa  103  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 
673 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
657 aa  102  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  39.1 
 
 
642 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  40.67 
 
 
655 aa  101  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  39.1 
 
 
642 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  36.72 
 
 
638 aa  101  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 
657 aa  100  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  39.74 
 
 
660 aa  100  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 
657 aa  100  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  38.22 
 
 
590 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 
650 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  40.44 
 
 
637 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  44.3 
 
 
643 aa  100  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  41.29 
 
 
650 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  35.75 
 
 
648 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  38.51 
 
 
649 aa  99.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.51 
 
 
649 aa  99.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
661 aa  99.4  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  34.05 
 
 
659 aa  99  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  40.4 
 
 
655 aa  98.6  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>