More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0376 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 730 aa  1449    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  32.74 
 
 		 797 aa  180  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 750 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  34.42 
 
 		 750 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 		 756 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  34.36 
 
 		 750 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  27.78 
 
 		 719 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  27.81 
 
 		 747 aa  160  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 		 748 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  27.52 
 
 		 709 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  27.48 
 
 		 709 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  25.69 
 
 		 715 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  26.04 
 
 		 720 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  25.68 
 
 		 798 aa  124  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  28.94 
 
 		 698 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  29.28 
 
 		 716 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  26.57 
 
 		 721 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  24.31 
 
 		 731 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  23.56 
 
 		 724 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  31.07 
 
 		 833 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  24.51 
 
 		 730 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  24.51 
 
 		 730 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  28.69 
 
 		 664 aa  104  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  35.02 
 
 		 603 aa  103  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 		 688 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  35.8 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  37.09 
 
 		 735 aa  101  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  30.54 
 
 		 774 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  30.54 
 
 		 774 aa  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  32.67 
 
 		 593 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  32.67 
 
 		 593 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  27.97 
 
 		 782 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  40.14 
 
 		 673 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  30.84 
 
 		 776 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  27.49 
 
 		 650 aa  99.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  29.52 
 
 		 729 aa  99.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  28.1 
 
 		 650 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  28.41 
 
 		 642 aa  98.2  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  27.79 
 
 		 650 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  28.1 
 
 		 650 aa  97.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 777 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  31.93 
 
 		 757 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  40.43 
 
 		 677 aa  97.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  27.79 
 
 		 607 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  35.54 
 
 		 651 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  34.94 
 
 		 651 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  28.16 
 
 		 645 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  34.94 
 
 		 651 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  34.94 
 
 		 651 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  34.94 
 
 		 651 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  34.94 
 
 		 651 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  34.94 
 
 		 651 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  28.33 
 
 		 760 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  34.94 
 
 		 651 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 		 187 aa  95.9  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  30.72 
 
 		 188 aa  94.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  35.44 
 
 		 735 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  27.79 
 
 		 650 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  27.79 
 
 		 650 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.04 
 
 		 669 aa  94.4  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 726 aa  94.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  29.18 
 
 		 788 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 643 aa  92.8  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  25.55 
 
 		 663 aa  92.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  30.1 
 
 		 643 aa  92.8  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 195 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  34.3 
 
 		 678 aa  92  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.3 
 
 		 661 aa  92  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 661 aa  92.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  27.96 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  27.96 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  27.88 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 685 aa  92  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  28.53 
 
 		 808 aa  92  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  27.96 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  27.96 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  27.96 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  27.79 
 
 		 709 aa  91.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  28.1 
 
 		 201 aa  91.3  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 800 aa  90.9  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  35.1 
 
 		 677 aa  90.9  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  27.96 
 
 		 645 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  27.96 
 
 		 645 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  27.96 
 
 		 645 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  28.22 
 
 		 690 aa  90.9  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  26.08 
 
 		 654 aa  89.7  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  24.79 
 
 		 637 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  35.97 
 
 		 679 aa  89.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  29.06 
 
 		 645 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  36.15 
 
 		 556 aa  89  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  29.44 
 
 		 716 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  34.83 
 
 		 637 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  37.24 
 
 		 649 aa  89  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  38.17 
 
 		 691 aa  87.8  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 690 aa  87.8  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  34.46 
 
 		 706 aa  87.8  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 680 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  31.49 
 
 		 648 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  27.62 
 
 		 576 aa  87  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  24.92 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>