More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1286 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1286  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 668 aa  1313    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  36.78 
 
 		 608 aa  261  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.02 
 
 		 616 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  31.98 
 
 		 574 aa  200  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  34.97 
 
 		 590 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  33.91 
 
 		 588 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  30.85 
 
 		 592 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  33.77 
 
 		 499 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  28.71 
 
 		 774 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  28.95 
 
 		 774 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  35.43 
 
 		 671 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  28.87 
 
 		 808 aa  93.2  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  28.95 
 
 		 776 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  29.27 
 
 		 682 aa  90.5  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.26 
 
 		 603 aa  89.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  30.48 
 
 		 726 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  30.21 
 
 		 649 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.21 
 
 		 649 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  29.97 
 
 		 664 aa  88.6  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 680 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 641 aa  88.2  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  32.98 
 
 		 731 aa  88.2  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  36.26 
 
 		 641 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  30.38 
 
 		 679 aa  87.8  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  31.01 
 
 		 760 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 641 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 641 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.71 
 
 		 641 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  27.44 
 
 		 735 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  27.95 
 
 		 672 aa  85.5  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  34.57 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  30.23 
 
 		 788 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  31.29 
 
 		 757 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 804 aa  84.3  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  36.54 
 
 		 654 aa  84  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 		 748 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  34.62 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  30.36 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 		 693 aa  83.2  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 648 aa  82  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  35.67 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  32.97 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  40.97 
 
 		 661 aa  81.6  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  33.52 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  34.43 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 		 659 aa  80.9  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  32.97 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  26.39 
 
 		 643 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  34.94 
 
 		 648 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.39 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  34.76 
 
 		 660 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  34.67 
 
 		 193 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  29.35 
 
 		 747 aa  78.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 		 643 aa  78.2  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.75 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  29.5 
 
 		 709 aa  78.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.8 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  32.89 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.75 
 
 		 638 aa  77  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 730 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  29.33 
 
 		 655 aa  77  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  26.91 
 
 		 637 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 730 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 		 179 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  32.4 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  32.67 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.43 
 
 		 669 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  27.37 
 
 		 798 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  30.27 
 
 		 661 aa  75.5  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  32.67 
 
 		 593 aa  75.1  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  36.23 
 
 		 700 aa  75.1  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 716 aa  75.1  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  36.08 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  35.46 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  36.2 
 
 		 673 aa  74.3  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 641 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 		 660 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  29.08 
 
 		 782 aa  73.9  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 712 aa  73.9  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  26.2 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  31.08 
 
 		 642 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 		 644 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  33.51 
 
 		 649 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  31.08 
 
 		 642 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  36.65 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.54 
 
 		 644 aa  73.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  31.75 
 
 		 655 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 698 aa  72  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  28.61 
 
 		 685 aa  72.4  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  35.54 
 
 		 653 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>