More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2165 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 499 aa  984    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  34.22 
 
 		 616 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  41.09 
 
 		 574 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  32.3 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  29.64 
 
 		 590 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  34.97 
 
 		 588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1286  Lytic transglycosylase catalytic  33.42 
 
 		 668 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  33.51 
 
 		 592 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 682 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 		 776 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 		 774 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 		 774 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  32.19 
 
 		 664 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  31.95 
 
 		 726 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  31.19 
 
 		 760 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  32.04 
 
 		 788 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  32.1 
 
 		 679 aa  104  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  32.09 
 
 		 808 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 804 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  27.04 
 
 		 715 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  29.92 
 
 		 757 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  28.88 
 
 		 671 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 721 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  27.91 
 
 		 709 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 		 833 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  29.47 
 
 		 672 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  35.47 
 
 		 729 aa  96.7  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  28.53 
 
 		 642 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  31.25 
 
 		 654 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  30.84 
 
 		 777 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  41.04 
 
 		 690 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  26.18 
 
 		 709 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  34.3 
 
 		 731 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  32.55 
 
 		 661 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  28.19 
 
 		 772 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 		 691 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  30.11 
 
 		 691 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 645 aa  91.3  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 		 748 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  30.19 
 
 		 649 aa  90.1  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  34.67 
 
 		 603 aa  90.1  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  43.05 
 
 		 750 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 680 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  43.05 
 
 		 750 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  31.42 
 
 		 677 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 		 712 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.35 
 
 		 638 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 650 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  36.08 
 
 		 653 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 		 724 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  34.57 
 
 		 720 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 677 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  39.64 
 
 		 663 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.59 
 
 		 652 aa  87.8  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 730 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  43.26 
 
 		 750 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 653 aa  87  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  31.27 
 
 		 685 aa  87.4  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 730 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32.68 
 
 		 637 aa  87.4  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 642 aa  87  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  30.43 
 
 		 661 aa  87  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 649 aa  86.7  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  29.76 
 
 		 735 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  29.91 
 
 		 747 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.62 
 
 		 673 aa  86.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  30.59 
 
 		 685 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.79 
 
 		 649 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  25.07 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  36.26 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 719 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  36.26 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  36.42 
 
 		 649 aa  84.7  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  39.24 
 
 		 800 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  24.8 
 
 		 593 aa  84.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  31.03 
 
 		 782 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  26.77 
 
 		 663 aa  83.6  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.17 
 
 		 747 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  27.38 
 
 		 645 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  26.19 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  39.61 
 
 		 678 aa  82.8  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  28.53 
 
 		 746 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  25.76 
 
 		 654 aa  82.8  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  27.38 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  27.38 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  27.38 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  27.38 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  27.38 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  35.33 
 
 		 660 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  35.12 
 
 		 659 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  30.92 
 
 		 680 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  28.99 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  27.46 
 
 		 645 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  27.46 
 
 		 645 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  34.52 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  27.46 
 
 		 645 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  34.52 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  36.91 
 
 		 645 aa  81.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>