287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0107 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0107  soluble lytic murein transglycosylase, putative  100 
 
 		 540 aa  1107    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0440  putative soluble lytic murein transglycosylase  46.72 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00101982  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1378  putative soluble lytic murein transglycosylase  50.98 
 
 		 542 aa  484  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1546  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.3 
 
 		 545 aa  478  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0719  soluble lytic murein transglycosylase, SLT family  46.87 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.273339  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0930  soluble lytic murein transglycosylase, putative  47.07 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0395136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0859  soluble lytic murein transglycosylase, putative  47.07 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.509195  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0992  soluble lytic murein transglycosylase, putative  46.31 
 
 		 541 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0469572  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0678  Lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 		 547 aa  332  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.906307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  32.93 
 
 		 654 aa  86.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 671 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  34.91 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 		 616 aa  81.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  31.18 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  32.57 
 
 		 690 aa  81.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  32.28 
 
 		 833 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 647 aa  80.1  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  28.31 
 
 		 199 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 777 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  29.7 
 
 		 720 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  30.64 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  35 
 
 		 669 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  28.93 
 
 		 197 aa  75.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  29.73 
 
 		 729 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 735 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  31.9 
 
 		 187 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 574 aa  73.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  29.78 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 		 800 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 193 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  30.2 
 
 		 643 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.25 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  29.56 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  27.75 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  27.62 
 
 		 628 aa  71.2  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  30.91 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  34.1 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  30.36 
 
 		 663 aa  70.5  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  28.74 
 
 		 650 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  28.74 
 
 		 650 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  30.21 
 
 		 677 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  29.65 
 
 		 607 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  28.74 
 
 		 650 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  28.9 
 
 		 655 aa  70.1  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  30.68 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  26.92 
 
 		 730 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  26.92 
 
 		 730 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 782 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  30.25 
 
 		 700 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  31.87 
 
 		 182 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  29.35 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  32.85 
 
 		 661 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 749 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  31.22 
 
 		 603 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 201 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  27.45 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  30.12 
 
 		 680 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  32.21 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  29.82 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  29.17 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  29.17 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  29.17 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  29.17 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  27.21 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  28.14 
 
 		 650 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  28.14 
 
 		 650 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  29.17 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  29.17 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  29.17 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  31.65 
 
 		 709 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  32 
 
 		 735 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  28.57 
 
 		 830 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  32.17 
 
 		 672 aa  66.6  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 		 661 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  28.24 
 
 		 757 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  27.16 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  31.79 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  29.24 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  28.57 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  27.78 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  33.09 
 
 		 641 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  25.48 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  30.11 
 
 		 804 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.33 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  29.24 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  27.49 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  27.49 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  28.24 
 
 		 760 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  33.13 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  29.93 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  27.49 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  29.24 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  27.49 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  27.86 
 
 		 763 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>