More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2022 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 166 aa  336  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  38.85 
 
 		 201 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  49.36 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  39.76 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 190 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  40.13 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  40.76 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  41.21 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  44.81 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  42.25 
 
 		 195 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 188 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  44.67 
 
 		 285 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  33.76 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  42.86 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 724 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  43.57 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  37.91 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  38.96 
 
 		 735 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 193 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  40.13 
 
 		 179 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 603 aa  100  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  40.67 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  36.05 
 
 		 219 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 296 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 296 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  39.72 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 661 aa  94.4  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.72 
 
 		 203 aa  94  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 663 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 730 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  37.18 
 
 		 643 aa  91.3  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 649 aa  91.3  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 730 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  39.44 
 
 		 206 aa  90.5  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  40.28 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.97 
 
 		 649 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  36.18 
 
 		 663 aa  90.5  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  37.75 
 
 		 678 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 218 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  37.75 
 
 		 719 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32.45 
 
 		 637 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  38.93 
 
 		 654 aa  88.6  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 731 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  39.62 
 
 		 669 aa  88.6  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  35.67 
 
 		 642 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 833 aa  88.2  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  35.67 
 
 		 642 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40.29 
 
 		 206 aa  87.4  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.67 
 
 		 661 aa  87.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 260 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  35.67 
 
 		 690 aa  87  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 657 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 707 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  38.06 
 
 		 657 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  36.94 
 
 		 660 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  42.42 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  36.88 
 
 		 202 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  36.88 
 
 		 709 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 677 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  36.88 
 
 		 709 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  35.33 
 
 		 716 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  35.76 
 
 		 690 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.03 
 
 		 642 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  35.76 
 
 		 659 aa  85.9  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  40.71 
 
 		 208 aa  85.5  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 729 aa  85.5  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  35.12 
 
 		 698 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  35.57 
 
 		 643 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 		 653 aa  85.1  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  35.97 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  35.03 
 
 		 650 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  36.14 
 
 		 664 aa  84.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  35.06 
 
 		 715 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  38.19 
 
 		 661 aa  84.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  34.39 
 
 		 642 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 642 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  36.42 
 
 		 748 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  42.96 
 
 		 242 aa  84  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 		 721 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  35.21 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  35.21 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  34.12 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  41.79 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  40.71 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 686 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  38.55 
 
 		 574 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.03 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  41.79 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  39.26 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  33.76 
 
 		 657 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  33.76 
 
 		 641 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 		 304 aa  81.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 		 649 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  36.55 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  35.22 
 
 		 673 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  34.03 
 
 		 643 aa  81.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 		 655 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>