More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0399 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 574 aa  1122    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.15 
 
 		 603 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 482 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 782 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  38.55 
 
 		 166 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 756 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  36.71 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 777 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  37.34 
 
 		 833 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.97 
 
 		 553 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  32.16 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 		 748 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.74 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  36.18 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 798 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  33.66 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 750 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  32.92 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  32.92 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 750 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  36.94 
 
 		 750 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 234 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  43.4 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 195 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  30.99 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  37.34 
 
 		 182 aa  72.8  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  35.03 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  42.73 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  30.96 
 
 		 716 aa  71.2  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  41.28 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.59 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  42.48 
 
 		 244 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 800 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  30.86 
 
 		 199 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  32.12 
 
 		 730 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  43.12 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 		 193 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.68 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  33.16 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  35.15 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  33.54 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  31.61 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  38.21 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  29.24 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  34.78 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  38.73 
 
 		 216 aa  67  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 217 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  38.69 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  43.27 
 
 		 530 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  37.1 
 
 		 206 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 		 661 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  38.24 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 228 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  31.79 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  33.11 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  40.37 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  38.28 
 
 		 154 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 228 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.57 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  31.36 
 
 		 242 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  41.75 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  33.77 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  36.03 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  37.61 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41.28 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0555  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  37.82 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 797 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  42.7 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  38.66 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  29.63 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  39.23 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  38.66 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 649 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  41.88 
 
 		 262 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  38.02 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  36.3 
 
 		 438 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  40.85 
 
 		 281 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>