More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2563 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
228 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  98.25 
 
 
228 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  97.17 
 
 
228 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  65.71 
 
 
234 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  49.49 
 
 
200 aa  85.5  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  43.28 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  52.17 
 
 
438 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  38.06 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.95 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.11 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  45.54 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  38.15 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  48.48 
 
 
202 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  46 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  45 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  44.66 
 
 
677 aa  72.8  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  44.9 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  30.38 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 
282 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  43.12 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  32.72 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  35.1 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  44.33 
 
 
690 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  43 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  38.02 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  43.3 
 
 
158 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  42.86 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  45.1 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  32.92 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  39.06 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  42.55 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  48.96 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  46.88 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  35.58 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  45.26 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  44.57 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  36.64 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.72 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  35.83 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.13 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  41.24 
 
 
798 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  38.41 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  36.88 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.86 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  41.59 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.17 
 
 
649 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  35.29 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  43 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 
649 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  39.71 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  45.54 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.94 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  47.71 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  39.06 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  37.1 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 
154 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  41.07 
 
 
678 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  39.39 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 
716 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 
574 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  36.22 
 
 
643 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  43.62 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  46.23 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.43 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  40.95 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>