More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_4016 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  42.29 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  48.72 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  48.78 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  40.6 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  43.08 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  49.56 
 
 		 438 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  40.85 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  40.46 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  44.19 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  48.03 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  45.19 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  45.19 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  48.74 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  41.04 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  48.33 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  49.11 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  49.15 
 
 		 362 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  47.37 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 		 191 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  47.01 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  45.3 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  44.64 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  49.53 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  42.52 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  39.74 
 
 		 362 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  52.73 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  46.23 
 
 		 329 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  45.59 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  41.22 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  46.09 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  43.85 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  45.28 
 
 		 199 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  40.76 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 		 442 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  42.52 
 
 		 299 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  42.31 
 
 		 202 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 280 aa  91.7  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 390 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  41.09 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  41.73 
 
 		 203 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  48.28 
 
 		 354 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  45.24 
 
 		 198 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  42.62 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  44.09 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  46.55 
 
 		 189 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  43.94 
 
 		 191 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  40.87 
 
 		 280 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.07 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 194 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.15 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  45.3 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.19 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  43.36 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 196 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  38.93 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.44 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 262 aa  85.1  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  41.8 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  39.1 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  41.8 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  43.09 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.88 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  38.71 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 1160 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  40.17 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  42.55 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  43.61 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  39.53 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.3 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  43.12 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  42.28 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  33.33 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>