More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0976 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  55.36 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  51.63 
 
 		 310 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  52.05 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  53.33 
 
 		 338 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  62.3 
 
 		 301 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.53 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  63.11 
 
 		 242 aa  157  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  53.5 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  51.7 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  61.79 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  57.52 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  50.82 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  47.03 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  64.91 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  48.19 
 
 		 265 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  54 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  51.53 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  46.74 
 
 		 272 aa  151  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  56.67 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  52.29 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  49.12 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  58.2 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  53.55 
 
 		 240 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  54.67 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  53.59 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  48.77 
 
 		 336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  53.54 
 
 		 439 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  58.06 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  56.3 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  56.3 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  59.13 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  48.43 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  48.57 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  39.7 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  50.82 
 
 		 484 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 460 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  45.62 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  54.55 
 
 		 120 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  47.58 
 
 		 191 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  48.15 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 280 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  44.12 
 
 		 299 aa  92.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  42.64 
 
 		 189 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 663 aa  90.9  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  45.53 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  43.08 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  49.6 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.61 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  43.51 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  42.45 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.75 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  44.03 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  41.98 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  41.98 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  41.98 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 251 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.77 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  44.62 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  43.41 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  46.77 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  41.13 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  40.77 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  41.09 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  41.22 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  43.18 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  41.54 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  42.97 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  43.31 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  44.62 
 
 		 661 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  43.55 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  36.92 
 
 		 643 aa  79  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  42.54 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.86 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.73 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  42.28 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.29 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  41.6 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  38.74 
 
 		 643 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  41.8 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.03 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  44.19 
 
 		 650 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.31 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  40.31 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  36.15 
 
 		 644 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  47.15 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>