More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2468 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 234 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  66.19 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  66.19 
 
 		 228 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  65.71 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  48.65 
 
 		 438 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  47.29 
 
 		 198 aa  85.5  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  46.67 
 
 		 690 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  44.07 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  41.13 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.04 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  47.47 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  44.53 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  40 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  41.12 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  40.32 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  33.82 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  51.04 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  48.04 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.59 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  45 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  43.1 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.74 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  35.82 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  46.46 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 574 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  40.95 
 
 		 798 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  33.54 
 
 		 637 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  37.68 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  43.61 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  44.64 
 
 		 196 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 152 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.04 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 280 aa  72  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  44.35 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  32.26 
 
 		 643 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.31 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.32 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  38.32 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  44.71 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  40.3 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  40.13 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  38.13 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  42.45 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  43.14 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  35.29 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  42.73 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.42 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  41.51 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  39.2 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  43 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  34.31 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  37.35 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  45.35 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  40.51 
 
 		 677 aa  69.3  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.59 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  48.35 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  40.87 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.98 
 
 		 669 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  44.34 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 730 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 730 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  39.69 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  30.81 
 
 		 390 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.53 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  34.26 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  50.56 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  39.57 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  43.16 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  39.34 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  32.11 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>