More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3164 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  70.23 
 
 
279 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  60.71 
 
 
295 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  56.03 
 
 
300 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  56.03 
 
 
292 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  56.82 
 
 
281 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  50.46 
 
 
290 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  46.93 
 
 
296 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  46.21 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  50.88 
 
 
285 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 
260 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  44.39 
 
 
280 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  41.55 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  37.09 
 
 
204 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.61 
 
 
214 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  35.65 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  35.44 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  36.02 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  34.98 
 
 
202 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  43.07 
 
 
256 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  34.18 
 
 
204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 
198 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  45.93 
 
 
198 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  35.89 
 
 
209 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  37.8 
 
 
209 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  32.3 
 
 
188 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 
209 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 
209 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  44.27 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 
215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  47.69 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  37.33 
 
 
211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  47.45 
 
 
278 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  44.16 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  41.21 
 
 
300 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  34.76 
 
 
230 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  45.38 
 
 
146 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  44.37 
 
 
235 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  36.24 
 
 
218 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  48.39 
 
 
201 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 
280 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  46.88 
 
 
217 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 
208 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 
203 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  35.75 
 
 
212 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  35.27 
 
 
206 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  44.88 
 
 
261 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  44.27 
 
 
283 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  44.27 
 
 
174 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 
247 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 
216 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  39.85 
 
 
206 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 
332 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  43.38 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  36.56 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  44.72 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  46.77 
 
 
189 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.04 
 
 
318 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  43.9 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  32.33 
 
 
195 aa  96.3  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  42.31 
 
 
241 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  39.85 
 
 
233 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  35.07 
 
 
242 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  46.4 
 
 
194 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 
756 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
202 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  41.98 
 
 
207 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  39.38 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 
263 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  38.29 
 
 
228 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  40.58 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  31.6 
 
 
199 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  43.08 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 
198 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  38.75 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  39.38 
 
 
195 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 
442 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  40.46 
 
 
197 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
249 aa  92.8  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  36.72 
 
 
293 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  43.9 
 
 
197 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  34.98 
 
 
243 aa  92  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 
218 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.6 
 
 
217 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  37.42 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 
224 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.55 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 
194 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 
199 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 
155 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.24 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  38.35 
 
 
195 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  43.65 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  43.65 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>