More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0527 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  90.26 
 
 		 154 aa  275  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  66.67 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  60.66 
 
 		 280 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  52.59 
 
 		 206 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  52.73 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 244 aa  110  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  54.78 
 
 		 199 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 		 260 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 283 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  52.03 
 
 		 281 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 247 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  44.55 
 
 		 191 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 		 202 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  43.41 
 
 		 362 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  45.97 
 
 		 285 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2727  lytic transglycosylase, catalytic  53.45 
 
 		 192 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  55.05 
 
 		 325 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 263 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  52.68 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.11 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 		 442 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  56.07 
 
 		 218 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  46.03 
 
 		 242 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  47.46 
 
 		 207 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 		 218 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  50.88 
 
 		 318 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  45.6 
 
 		 204 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 		 280 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  45.6 
 
 		 204 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  44.8 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 		 204 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  44.09 
 
 		 362 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  50.47 
 
 		 217 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  43.55 
 
 		 296 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  43.55 
 
 		 296 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  49.54 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  51.89 
 
 		 200 aa  101  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 291 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 191 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  43.55 
 
 		 204 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  48.21 
 
 		 194 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  48.18 
 
 		 438 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44.26 
 
 		 249 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  44.14 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 204 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  46.85 
 
 		 189 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  47.11 
 
 		 216 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  43.61 
 
 		 203 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 196 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  45.22 
 
 		 211 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  46.85 
 
 		 204 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  39.26 
 
 		 202 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 199 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  48.74 
 
 		 208 aa  98.2  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  46.3 
 
 		 280 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 		 261 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  51.43 
 
 		 206 aa  97.1  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  47.62 
 
 		 290 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  50.48 
 
 		 204 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 370 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.24 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  50.45 
 
 		 217 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 198 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 		 245 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  50 
 
 		 278 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  44.09 
 
 		 354 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 239 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 239 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  48.65 
 
 		 206 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.36 
 
 		 239 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 251 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 251 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 251 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 		 243 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  48.25 
 
 		 271 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  41.67 
 
 		 273 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  39.84 
 
 		 222 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 		 326 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  42.5 
 
 		 305 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.66 
 
 		 327 aa  94.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 		 233 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 		 295 aa  93.6  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 237 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  36.24 
 
 		 201 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  46.4 
 
 		 197 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  47.17 
 
 		 368 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  48.18 
 
 		 189 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  45.37 
 
 		 217 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  44.88 
 
 		 329 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  47.11 
 
 		 218 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  44.09 
 
 		 360 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  44.36 
 
 		 215 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  42.28 
 
 		 279 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 245 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  46.28 
 
 		 224 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  36.62 
 
 		 215 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>