More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3262 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  68.81 
 
 		 196 aa  275  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  56.1 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  71.11 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  53.05 
 
 		 260 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  75.41 
 
 		 282 aa  201  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  48.82 
 
 		 258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  54.35 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  57.5 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  53.45 
 
 		 280 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  51.2 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  48.65 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  46.48 
 
 		 244 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  51.22 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  51.67 
 
 		 217 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  47.97 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  49.24 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  48.98 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  48 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  53.28 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.05 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  48.82 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  42.5 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  48.36 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  48.78 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  48.28 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  46.56 
 
 		 281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  49.58 
 
 		 438 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  47.97 
 
 		 299 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  46.83 
 
 		 305 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  46.03 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.8 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  43.41 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 239 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  51.67 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  48.36 
 
 		 245 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  54.72 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  49.61 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  43.54 
 
 		 442 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  48.33 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.9 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  47.93 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  43.05 
 
 		 216 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  48.41 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 245 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44.88 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  44.85 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  48.65 
 
 		 297 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  48.65 
 
 		 297 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  50.91 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.9 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  49.59 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 300 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  47.11 
 
 		 283 aa  104  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0555  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 321 aa  104  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  45.53 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  44.29 
 
 		 362 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  42.11 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  45.22 
 
 		 261 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  45.22 
 
 		 261 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  45.16 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  44.35 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  41.33 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 318 aa  101  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  47.32 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  43.9 
 
 		 295 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  43.48 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 		 296 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 326 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  40.6 
 
 		 296 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  44.07 
 
 		 328 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  40.13 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  43.48 
 
 		 261 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  45.61 
 
 		 238 aa  99.4  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  40.13 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  42.61 
 
 		 261 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  42.61 
 
 		 261 aa  99  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  42.61 
 
 		 261 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  42.61 
 
 		 261 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 		 291 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 304 aa  98.6  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>