More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0555 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0555  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 321 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  49.56 
 
 		 241 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  44.96 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  46.02 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  49.14 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.03 
 
 		 188 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  38.52 
 
 		 174 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  44.74 
 
 		 146 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  46.88 
 
 		 235 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  43.86 
 
 		 191 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 		 202 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 		 438 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  42.59 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 		 217 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.68 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  41.23 
 
 		 195 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  42.42 
 
 		 204 aa  85.9  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.21 
 
 		 202 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  47.78 
 
 		 228 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.52 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  42.42 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.16 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  39.66 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.6 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  41.44 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  43.14 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.57 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  47.31 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  43.62 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  43.3 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  39.68 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.21 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  41.12 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  41.57 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  36.88 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  40.2 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  37.39 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.67 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  37.07 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  40.86 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  43.4 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  39.05 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  32.59 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  36.44 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  44.05 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  35.88 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  38.28 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  38.28 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  41.94 
 
 		 201 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  37.04 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  36.15 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  38.18 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.78 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  35.45 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  39.17 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  31.39 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  30.66 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  29.77 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  33.33 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>