More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0451 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  55.92 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  41.52 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  49.19 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  39.63 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  45.31 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  41.22 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  42.97 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  47.79 
 
 		 190 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  41.48 
 
 		 190 aa  88.6  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  39.13 
 
 		 175 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  49.47 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  44.76 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  46.81 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  36.02 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  45.26 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  45.36 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  46.39 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  38.99 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  44.33 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  44.34 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  37.58 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  37.58 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  43.62 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.76 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.44 
 
 		 603 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  48.24 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  43.31 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  46.24 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  38.81 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 		 677 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 782 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  34.39 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40.4 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  46.43 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.76 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 304 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  42.53 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  31.37 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  40.32 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 673 aa  66.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  33.16 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.53 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  32.58 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  35.9 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  41.76 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  42.16 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.66 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  43.33 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  40.66 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  40.2 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  40.66 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.11 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  40.23 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  37.93 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  42.35 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  34.71 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  37.93 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  40.86 
 
 		 690 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  39.29 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  39.29 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  33.91 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>