More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4565 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
314 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  52.73 
 
 
322 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  55.21 
 
 
253 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  61.75 
 
 
210 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4448  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 
250 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  44.23 
 
 
196 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  49.59 
 
 
204 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 
204 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  47.15 
 
 
198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  47.97 
 
 
202 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 
191 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  44.88 
 
 
233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  46.28 
 
 
217 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  46.88 
 
 
207 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.61 
 
 
214 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  48.48 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  46.34 
 
 
206 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  47.97 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
263 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  47.15 
 
 
244 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  46.34 
 
 
203 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  37.66 
 
 
189 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  50 
 
 
296 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
296 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  49.18 
 
 
218 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 
299 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 
297 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.02 
 
 
297 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 
438 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 
280 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  36.21 
 
 
235 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  44.63 
 
 
273 aa  102  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 
212 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6203  Lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 
384 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0827287  normal  0.0199903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 
206 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 
245 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 
247 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  46.55 
 
 
208 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.07 
 
 
215 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  46.27 
 
 
304 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 
199 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  47.41 
 
 
204 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  43.8 
 
 
305 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  48.39 
 
 
293 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 
271 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  38.32 
 
 
228 aa  99.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 
222 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  45.97 
 
 
256 aa  99  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  44.03 
 
 
328 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  42.98 
 
 
174 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  43.86 
 
 
211 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 
216 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.56 
 
 
217 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  41.88 
 
 
200 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  50.96 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 
202 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 
251 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
442 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  45.05 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 
261 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  37.06 
 
 
216 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
215 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  43.61 
 
 
197 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  55 
 
 
201 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  37.24 
 
 
188 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 
242 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  44.74 
 
 
278 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  37.33 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  43.86 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  43.86 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  43.86 
 
 
239 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  37.06 
 
 
221 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  41.8 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  44.92 
 
 
362 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  43.08 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 
251 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  43.8 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
195 aa  93.2  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 
251 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.86 
 
 
239 aa  92.8  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  43.44 
 
 
243 aa  92.8  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 
362 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 
251 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  43.86 
 
 
271 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.91 
 
 
199 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 
249 aa  92.4  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  32.34 
 
 
237 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
292 aa  92.4  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.61 
 
 
318 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  56.47 
 
 
272 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  44.35 
 
 
197 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  42.61 
 
 
234 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  44.74 
 
 
218 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  39.63 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.79 
 
 
226 aa  90.5  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 
146 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  42.19 
 
 
281 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>