More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1002 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
271 aa  537  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  52.61 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  52.99 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  51.67 
 
 
293 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  59.69 
 
 
282 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  50.4 
 
 
272 aa  218  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  52.86 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  55.12 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  55.12 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  54.26 
 
 
218 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  57.8 
 
 
299 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  49.21 
 
 
300 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  52.54 
 
 
263 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  55.38 
 
 
304 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.59 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  55.75 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  46.97 
 
 
216 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  50.38 
 
 
212 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  55.24 
 
 
189 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  52.46 
 
 
208 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  52.59 
 
 
207 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.37 
 
 
196 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  50.44 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  53.1 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  49.18 
 
 
215 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  41.1 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  50 
 
 
197 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 
197 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  49.58 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  51.43 
 
 
204 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
218 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  53.33 
 
 
202 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 
204 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1601  Lytic transglycosylase catalytic  58.56 
 
 
321 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  42.75 
 
 
281 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  51.24 
 
 
212 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  51.92 
 
 
247 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 
216 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  44.37 
 
 
242 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  55.56 
 
 
221 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 
203 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  54.63 
 
 
271 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 
332 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  54.63 
 
 
278 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  50.51 
 
 
174 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  43.97 
 
 
273 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  50.47 
 
 
188 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 
305 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
280 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50.96 
 
 
442 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  47.58 
 
 
215 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  50.46 
 
 
198 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  49.07 
 
 
235 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  55.1 
 
 
206 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
217 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 
314 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 
199 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
191 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  45.37 
 
 
283 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  50.41 
 
 
300 aa  99  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 
292 aa  98.6  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  50.96 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  51.92 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.8 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  52.38 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  50.5 
 
 
204 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.03 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  45.6 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  44.72 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  46.85 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  46.43 
 
 
290 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 
210 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  44.72 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  49.04 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  36.72 
 
 
233 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  51.82 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  48.18 
 
 
194 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  53.33 
 
 
201 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  49 
 
 
199 aa  96.3  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  50.96 
 
 
329 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 
299 aa  95.5  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  48.57 
 
 
253 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  49.22 
 
 
280 aa  95.5  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  46.03 
 
 
203 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  48.08 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  43.09 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  48.08 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  51.4 
 
 
194 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  48.08 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  51.75 
 
 
281 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  48.72 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  48.72 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
244 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 
228 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  48.54 
 
 
200 aa  93.2  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  45.11 
 
 
209 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>