More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1595 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 378 aa  757    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  51.17 
 
 		 429 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.51 
 
 		 388 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  33.01 
 
 		 375 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  39.74 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  32.75 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  39.74 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  35.82 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  39.74 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  39.74 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  39.74 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  39.3 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  39.3 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  39.3 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  39.3 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  39.3 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  39.3 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  37.55 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  38.86 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  38.86 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  38.86 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  42.77 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  33.68 
 
 		 360 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  37.12 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  32.53 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  37.12 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  37.12 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  37.12 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  37.12 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  30.07 
 
 		 340 aa  144  4e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  32.16 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  38.29 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  32.76 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.69 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  33.91 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  29.63 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 519 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  28.16 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  37.64 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 		 233 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 		 220 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  33.93 
 
 		 212 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  33.93 
 
 		 212 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  37.65 
 
 		 272 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  26.5 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 203 aa  96.3  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  34.19 
 
 		 203 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 203 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  34.19 
 
 		 203 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  34.19 
 
 		 241 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 203 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  34.19 
 
 		 241 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.55 
 
 		 203 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.55 
 
 		 203 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  33.55 
 
 		 241 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  34.32 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  43.12 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  43.36 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  39.26 
 
 		 677 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.67 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  40.71 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.15 
 
 		 669 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  43.64 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  33.74 
 
 		 203 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  31.76 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  37.9 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  37.34 
 
 		 715 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  33.13 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  32.97 
 
 		 719 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 201 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  30 
 
 		 226 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  32.3 
 
 		 645 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  39.67 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.07 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  41.59 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  36.14 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 258 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 		 237 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  36.09 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  35.88 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  35.46 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  32.3 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  32.3 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.68 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  32.3 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  32.3 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  35.46 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  35.46 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  37.68 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>