More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1816 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  71.93 
 
 		 233 aa  327  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  49.76 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  49.76 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  50.24 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  49.76 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  49.76 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  49.76 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  49.76 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  49.76 
 
 		 241 aa  208  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  49.76 
 
 		 203 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  48.58 
 
 		 203 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  52.17 
 
 		 374 aa  180  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  50.89 
 
 		 360 aa  178  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  51.55 
 
 		 374 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  50 
 
 		 359 aa  175  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  48.81 
 
 		 363 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  49.39 
 
 		 359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  49.39 
 
 		 360 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  49.39 
 
 		 359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  49.39 
 
 		 359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  49.39 
 
 		 360 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  49.39 
 
 		 359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  49.39 
 
 		 359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  49.39 
 
 		 359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  50.31 
 
 		 362 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  50.31 
 
 		 358 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  50.31 
 
 		 358 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  49.69 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  48.17 
 
 		 361 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  48.17 
 
 		 361 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  48.17 
 
 		 361 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  48.17 
 
 		 361 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  48.17 
 
 		 361 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  50 
 
 		 360 aa  167  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  48.17 
 
 		 358 aa  164  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  46.54 
 
 		 340 aa  154  7e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  46.06 
 
 		 372 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  45.91 
 
 		 375 aa  148  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  46.25 
 
 		 376 aa  147  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  45.73 
 
 		 378 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  43.83 
 
 		 388 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  38.25 
 
 		 296 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 354 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.56 
 
 		 373 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  41.36 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 349 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 377 aa  121  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  37.87 
 
 		 413 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 		 429 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 359 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 378 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  35.95 
 
 		 519 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 427 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  32.49 
 
 		 385 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  30.36 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  42.17 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  40.96 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  43.18 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  33.9 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  41.96 
 
 		 681 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  31.25 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  40.24 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  35.35 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  33.9 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.11 
 
 		 649 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1319  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 		 649 aa  58.9  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.96 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  33.91 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.96 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  34.17 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  38.55 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  39.77 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  32.8 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  49.09 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  39.76 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  27.27 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  27.14 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  36.73 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>