More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3132 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 354 aa  735    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  71.6 
 
 		 349 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.23 
 
 		 375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.81 
 
 		 373 aa  222  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  42.76 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 376 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  43.79 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  42.12 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  41.9 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  43.01 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  42.47 
 
 		 359 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.47 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  42.47 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  44.91 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  42.47 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  44.91 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  42.47 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  44.91 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  42.47 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  42.47 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  42.47 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  42.47 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  41.44 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  41.44 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  41.44 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  41.44 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  41.44 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  41.44 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  41.44 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  41.61 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  40.55 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  42.31 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  39.93 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  40.85 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.01 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  36.52 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  46.63 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 220 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  44.44 
 
 		 212 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  44.44 
 
 		 212 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  42.94 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  29.59 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  38.89 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.89 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.89 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  38.89 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.89 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.89 
 
 		 241 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.89 
 
 		 203 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 203 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  34.45 
 
 		 519 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  28.16 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 215 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  35.47 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  35.16 
 
 		 272 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.64 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  31.48 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  35.25 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 661 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.61 
 
 		 196 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  36.07 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  31.97 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  33.94 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.34 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  37.61 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  33.94 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  35.09 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  32.16 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.92 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  33.75 
 
 		 645 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.65 
 
 		 603 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 		 166 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  33.75 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  33.75 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  31.97 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  32.45 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  33.75 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  33.75 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  33.75 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  33.75 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  29.11 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  33.75 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  33.57 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  31.36 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>