More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002444 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  81.67 
 
 		 375 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  92.18 
 
 		 376 aa  721    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  100 
 
 		 372 aa  773    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  69.35 
 
 		 378 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  63.17 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  64.56 
 
 		 296 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  46.35 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  49.08 
 
 		 358 aa  335  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  49.39 
 
 		 360 aa  329  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  48.77 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  49.08 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  48.77 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  48.77 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  48.77 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  48.77 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  48.77 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  48.77 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  45.72 
 
 		 362 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  45.72 
 
 		 358 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  45.72 
 
 		 358 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  48.77 
 
 		 359 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  48.94 
 
 		 374 aa  325  9e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  48.63 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  45.6 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  47.85 
 
 		 361 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  48.33 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  47.55 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  47.55 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  47.55 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  47.55 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  51.7 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  42.9 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  44.41 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  41.49 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  42.76 
 
 		 354 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  38.7 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.1 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  32.45 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  46.06 
 
 		 220 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  46.06 
 
 		 212 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  46.06 
 
 		 212 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  47.85 
 
 		 233 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  32.76 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  28.07 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  36.64 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 359 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  40.85 
 
 		 203 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  41.72 
 
 		 215 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.02 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.02 
 
 		 241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.02 
 
 		 241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  39.02 
 
 		 203 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 203 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 203 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  39.02 
 
 		 203 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.02 
 
 		 203 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  39.02 
 
 		 241 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  38.69 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  40.52 
 
 		 174 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  38.26 
 
 		 196 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 197 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  36.28 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  32.24 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.05 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 798 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  33.94 
 
 		 647 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.81 
 
 		 282 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 279 aa  67  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  38.05 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  37.72 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  37.82 
 
 		 593 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  37.82 
 
 		 593 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.79 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.72 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  37.07 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  31.16 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 		 649 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.3 
 
 		 649 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  32 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  32.53 
 
 		 748 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1286  Lytic transglycosylase catalytic  29.3 
 
 		 668 aa  63.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 782 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>