More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0297 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 385 aa  776    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  38.4 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  47.42 
 
 		 519 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  35.01 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  41.2 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  30.58 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  31.53 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  42.79 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  39.63 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  42.29 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  42.29 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  42.29 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  42.29 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  32.16 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  31.66 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.3 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  40.3 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  40.3 
 
 		 360 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  40.3 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  40.3 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  40.3 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  40.3 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  40.3 
 
 		 360 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  40.3 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  40.8 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  42.41 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  42.41 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  42.41 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.8 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  27.55 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  28.07 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  27.75 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  28.36 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  38.8 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  42.94 
 
 		 354 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  26.92 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 		 429 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  41.83 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 359 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 272 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  36.45 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.89 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  37.64 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  38.92 
 
 		 233 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  32.49 
 
 		 212 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  32.49 
 
 		 212 aa  97.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  32.49 
 
 		 220 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.78 
 
 		 241 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.78 
 
 		 241 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  38.78 
 
 		 203 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 203 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  38.78 
 
 		 203 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 203 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  38.1 
 
 		 241 aa  93.2  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  35.8 
 
 		 203 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  35.19 
 
 		 203 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 203 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  36.26 
 
 		 215 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  35.67 
 
 		 782 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  33.86 
 
 		 748 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  37.58 
 
 		 777 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  35.03 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 649 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.31 
 
 		 649 aa  79.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 833 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 660 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  34.5 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 800 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  32.34 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  32.93 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  32.1 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  32.76 
 
 		 657 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  33.14 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  28.04 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  32.76 
 
 		 657 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 		 729 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  30.94 
 
 		 660 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  35.1 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 661 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  31.45 
 
 		 645 aa  70.1  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  31.55 
 
 		 663 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 		 661 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  30.41 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  29.61 
 
 		 196 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.02 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  27.09 
 
 		 731 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  35.07 
 
 		 511 aa  67  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  30.54 
 
 		 456 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  29.17 
 
 		 256 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  28.49 
 
 		 643 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  34.16 
 
 		 260 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.03 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  33.92 
 
 		 763 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>