More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1463 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 413 aa  850    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  39.1 
 
 		 376 aa  190  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.23 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  38.49 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  38.32 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  38.7 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  37.82 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  35.83 
 
 		 340 aa  181  2.9999999999999997e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  37.96 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  37.59 
 
 		 360 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.21 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  38.7 
 
 		 362 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  38.7 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  38.7 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  37.25 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  36.13 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  36.13 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  35.77 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  35.77 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  35.77 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  35.77 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  35.4 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  35.4 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  35.4 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  35.4 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  35.4 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  35.4 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  35.4 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 360 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  35.4 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  36.16 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  37.31 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  33.59 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  33.46 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  34.88 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  39.43 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  36.63 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  38.74 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  36.45 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  37.87 
 
 		 220 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  37.87 
 
 		 212 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  37.87 
 
 		 212 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  39.05 
 
 		 203 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  36.42 
 
 		 203 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  36.42 
 
 		 203 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  36.42 
 
 		 203 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  36.42 
 
 		 241 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  36.42 
 
 		 203 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  36.42 
 
 		 241 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  36.42 
 
 		 241 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  36.42 
 
 		 203 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  35.76 
 
 		 203 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  37.58 
 
 		 215 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  35.58 
 
 		 272 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  31.35 
 
 		 519 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  32.16 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 		 756 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  28.51 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  31.93 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.58 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  31.55 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  31.55 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  29.76 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  33.63 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  31.5 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  28.27 
 
 		 218 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  30.59 
 
 		 209 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  28.27 
 
 		 197 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  28.42 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  28.42 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  28.72 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  30.34 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  28.07 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  33.05 
 
 		 188 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  28.81 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  32.24 
 
 		 190 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 175 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  34.23 
 
 		 193 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 603 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 608 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.52 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  31.39 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>