More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3028 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  85.96 
 
 		 374 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  100 
 
 		 360 aa  745    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  89.72 
 
 		 360 aa  682    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  85.96 
 
 		 374 aa  651    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  78.65 
 
 		 358 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  75.42 
 
 		 361 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  75.42 
 
 		 361 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  75.14 
 
 		 361 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  75.14 
 
 		 361 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  75.14 
 
 		 361 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  77.09 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  77.09 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  77.09 
 
 		 362 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  77.53 
 
 		 359 aa  565  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  75.35 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  75.07 
 
 		 360 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  75.35 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  75.35 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  75.35 
 
 		 360 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  75.07 
 
 		 359 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  75.35 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  75.35 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  74.79 
 
 		 359 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  53.89 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  52.17 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  49.47 
 
 		 375 aa  341  9e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  47.33 
 
 		 378 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  49.7 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  48.63 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.49 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  44.79 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  47.26 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  43.25 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  37.59 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  50 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  50 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  35.54 
 
 		 429 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  51.59 
 
 		 233 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  31.53 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.57 
 
 		 241 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.57 
 
 		 241 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  41.57 
 
 		 203 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  41.57 
 
 		 203 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  42.63 
 
 		 519 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  41.57 
 
 		 203 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  41.57 
 
 		 203 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.57 
 
 		 203 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.57 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  42.17 
 
 		 203 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  41.57 
 
 		 203 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  38.29 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  41.4 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  43.29 
 
 		 215 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  33.47 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  34.12 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  30.54 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  36.52 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  34.45 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  34.51 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  30.32 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  35.96 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 196 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  39.66 
 
 		 649 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 649 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  31.45 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  36.44 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  32.58 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  35.65 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  29.93 
 
 		 677 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.84 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  34.75 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.26 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  31.36 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 574 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  31.93 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  30.36 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  31.06 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>