More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4178 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 349 aa  717    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  71.6 
 
 		 354 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  44.37 
 
 		 375 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  42.57 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.57 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  41.28 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  42.57 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  42.57 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  42.57 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  42.57 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  42.57 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  42.57 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  42.23 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  41.49 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.4 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  41.89 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  41.5 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  41.89 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  41.89 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  41.89 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  41.89 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  42.23 
 
 		 359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  41.89 
 
 		 394 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  40.48 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  40.48 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  40.48 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  39.12 
 
 		 374 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  39.12 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  39.53 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  39.8 
 
 		 360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  39.31 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  37.07 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  36.95 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.39 
 
 		 429 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  38.8 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  43.93 
 
 		 233 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  40.59 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  41.52 
 
 		 519 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  40.59 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  39.51 
 
 		 203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.65 
 
 		 203 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  37.04 
 
 		 203 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 203 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 203 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.04 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  37.04 
 
 		 203 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.04 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.04 
 
 		 203 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.04 
 
 		 241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  35.84 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  35.39 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  26.5 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  36.47 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.54 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.54 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.7 
 
 		 196 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  29.09 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.05 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  29.09 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  28.19 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  28.38 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  27.32 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  34.9 
 
 		 677 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  35.07 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  31.44 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.82 
 
 		 647 aa  62.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.61 
 
 		 196 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  30.86 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  29.49 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  32.62 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  32.89 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  29.45 
 
 		 202 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 256 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  30.36 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  28.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  34.86 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  35.24 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  35.65 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  30.46 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  33.87 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  33.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  35.2 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  24.68 
 
 		 756 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  32.08 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  32.08 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>