More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0944 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  35.26 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.71 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.12 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  35.44 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  32.62 
 
 		 729 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  33.77 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  32.72 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.59 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 731 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 673 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  32.18 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  34.07 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.12 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1014  lytic transglycosylase catalytic  32.05 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.316435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.73 
 
 		 649 aa  69.3  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  31.45 
 
 		 700 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.73 
 
 		 649 aa  68.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 616 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  35.71 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  34.84 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  29.81 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  32.47 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  34.12 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.64 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  35.26 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  30.86 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  34.92 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  31.07 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  40.5 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  32.7 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  28.19 
 
 		 730 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  28.19 
 
 		 730 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  38.16 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  27.81 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  33.6 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  37.32 
 
 		 649 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  41.03 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  32.2 
 
 		 717 aa  63.2  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  31.64 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 		 663 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  37.3 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  36.07 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  35.57 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 735 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  33.87 
 
 		 174 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  30.81 
 
 		 677 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  29.46 
 
 		 201 aa  62  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  36.07 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  31.62 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  27.75 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  34.9 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  39.83 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  33.56 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  26.71 
 
 		 724 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  34.11 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  34.13 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  31.82 
 
 		 593 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  36.18 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  38.4 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  31.82 
 
 		 593 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  27.55 
 
 		 690 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  33.97 
 
 		 830 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  29.11 
 
 		 672 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.96 
 
 		 669 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  31.93 
 
 		 642 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 763 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  33.09 
 
 		 688 aa  59.3  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  31.48 
 
 		 748 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  30.14 
 
 		 682 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  34.96 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.78 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  37.39 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  33.99 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>