154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1014 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1014  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.316435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1311  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0244  lytic transglycosylase catalytic  31.05 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0246  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  32.05 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  33.03 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  35.45 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 154 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  30.91 
 
 		 717 aa  53.9  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  29.23 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.62 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 154 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 760 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 293 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  30.97 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  31.86 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  32.73 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  26.2 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  32.5 
 
 		 296 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  26.17 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.05 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  30.17 
 
 		 735 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  26.95 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  32.59 
 
 		 757 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  27.23 
 
 		 349 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  33 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  29.91 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 		 282 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  32.76 
 
 		 300 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  30.83 
 
 		 272 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  31.03 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  32.74 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 		 663 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  27.48 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  28.67 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  30.49 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  28 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  27.64 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  28.23 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  24.86 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  34.51 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  26.88 
 
 		 330 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  28.81 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.14 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1319  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  34.43 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 730 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  27.61 
 
 		 321 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 260 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  31.43 
 
 		 354 aa  45.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 729 aa  45.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  32.74 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  31.86 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 730 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0456  hypothetical protein  27.74 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  28.32 
 
 		 731 aa  44.7  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.57 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  34.48 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  25.95 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  30.91 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 647 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  29.46 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  26.96 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  29.73 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 643 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  29.79 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  26.18 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  29.59 
 
 		 698 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  32.04 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  31.86 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  27.45 
 
 		 388 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  27.21 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 649 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  29.06 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  30.91 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  26.67 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.19 
 
 		 616 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  28.45 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>