240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1311 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1311  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 177 aa  359  9e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0246  lytic transglycosylase, catalytic  54.42 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0244  lytic transglycosylase catalytic  53.74 
 
 		 197 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  42.95 
 
 		 238 aa  130  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1014  lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 202 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.316435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  40.19 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  37.88 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  27.23 
 
 		 304 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  35.76 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  43.62 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  32.37 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  31.15 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  32.52 
 
 		 603 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  32.59 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 		 438 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  31.39 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  33.05 
 
 		 663 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  36.27 
 
 		 717 aa  57  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  33.91 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  32.28 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  37.37 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  32.08 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  27.94 
 
 		 735 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  27.74 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  33.94 
 
 		 657 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 657 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 724 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  28.93 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 730 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 730 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 731 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  30.19 
 
 		 283 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  28.33 
 
 		 294 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  31.76 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  32.81 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 212 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 235 aa  51.6  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 		 649 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 653 aa  50.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  34.21 
 
 		 340 aa  51.2  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  35.05 
 
 		 716 aa  50.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  32.35 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  34.65 
 
 		 654 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.04 
 
 		 649 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  31.34 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  28.79 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 663 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  31.3 
 
 		 661 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  30.21 
 
 		 798 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  27.42 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 262 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  29.61 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  33.6 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 		 659 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 677 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 278 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  30.6 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  31.71 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  32.35 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  29 
 
 		 336 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  27.56 
 
 		 280 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  28.71 
 
 		 242 aa  48.5  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 295 aa  48.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  31.2 
 
 		 693 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  25.47 
 
 		 413 aa  47.8  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 690 aa  48.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 707 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  26.9 
 
 		 370 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  29.85 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  30.26 
 
 		 394 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  26.21 
 
 		 372 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  29.25 
 
 		 281 aa  47.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  26.21 
 
 		 372 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  30.15 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  26.98 
 
 		 260 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  30.26 
 
 		 395 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 374 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  28.43 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  33 
 
 		 648 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  31.78 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  26.21 
 
 		 378 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>